之前有一次，我導(dǎo)說“能不能把這些基因按順序畫在果蠅的染色體上”去枷，因此底瓣，我尋找了一些實(shí)現(xiàn)這個(gè)需求的方法。經(jīng)過一番奇奇怪怪的操作之后扭弧，最終用ggplot2畫了阎姥。。鸽捻。其它方法簡(jiǎn)單地...
IP屬地：貴州
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把基因畫在染色體上 -
群體遺傳學(xué)之個(gè)體間遺傳距離及其計(jì)算方法
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
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遺傳背景分析（群體結(jié)構(gòu)10個(gè)樣品以上）
2020.11.9【GWAS/WGS流程】丨全基因組關(guān)聯(lián)分析繪圖全流程_穆易青的博客-CSDN博客_gwas全基因組關(guān)聯(lián)分析[https://blog.csdn.net/ya...
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【群體遺傳】Treemix四倍體分析 & 最優(yōu)m值選擇距離上一次寫博客呼巴，已經(jīng)是上一次了。 之前已經(jīng)有生信菜鳥團(tuán)前輩寫過關(guān)于Treemix的分析御蒲，但值得關(guān)注的是衣赶，現(xiàn)在的軟件大部分都只適用于二倍體，那今天介紹一下四倍體怎么進(jìn)行Tre...
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群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)厚满，從而改變?nèi)后w“基因庫”的組成府瞄。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，是遺傳變異一個(gè)非常重要的來源碘箍，...
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5. GWAS：群體結(jié)構(gòu)——Admixture群體結(jié)構(gòu)是指材料的亞群分化情況遵馆，會(huì)導(dǎo)致標(biāo)記間的非連鎖關(guān)聯(lián)，進(jìn)而導(dǎo)致關(guān)聯(lián)分析結(jié)果出現(xiàn)假陽性丰榴。 地理隔離货邓、人工選擇、移民和遺傳漂變等都可能導(dǎo)致群體分化四濒。 是指遺傳變異在物種或群體...
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生信小工具：Plink之下載安裝與其基本格式（1）
談起Plink相信熟悉的人更定都會(huì)知道换况，這是一個(gè)全面的基因組分析工具集，具有很多的小功能盗蟆，在SNP數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)戈二，過濾，GWAS分析中都可以用得上喳资，而且速度非常的快挽拂，堪稱是生物信息...
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「比較基因組學(xué)」簡(jiǎn)單個(gè)性化之畫KaKs圖個(gè)性化需求 鑒定得到的wgd gene pair，TBtools計(jì)算得到TBtools.kaks.tab.xls骨饿，繪制Ks為橫坐標(biāo)亏栈，Ka為縱坐標(biāo)的點(diǎn)圖台腥，對(duì)各數(shù)據(jù)進(jìn)行分別以斜...
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使用vcftools對(duì)變異文件進(jìn)行群體分析Tajima D 這個(gè)是選擇相關(guān)的一個(gè)參數(shù)，大于0代表群體觀測(cè)雜合度高于預(yù)期雜合度绒北，稀有等位基因頻率降低（群體收縮或者平衡選擇）黎侈，小于0說明群體觀測(cè)雜合位點(diǎn)少于預(yù)期值，稀有等...
