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GSEA相關(guān)筆記整理網(wǎng)頁(yè)上關(guān)于GSEA富集分析的教程很多妙黍，對(duì)自己這個(gè)生信小白來(lái)說比較簡(jiǎn)單通俗易懂的當(dāng)數(shù)生信寶典和生信技能樹的教程了悴侵。感謝大佬們的付出。下面是自己整理的個(gè)人學(xué)習(xí)筆記拭嫁，可能有理解不對(duì)...
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富集分析DAVID可免、Metascape、Enrichr做粤、ClueGO前言 一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時(shí)看看它們的功能浇借，需要做個(gè)富集分析。雖然公司買了最新版的數(shù)據(jù)庫(kù)怕品，如KEGG妇垢，但在集群跑下來(lái)嫌麻煩。這時(shí)網(wǎng)頁(yè)在線或者本地化工具派上用場(chǎng)了堵泽。...
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讀《T-Cell Differentiation》||免疫細(xì)胞の名門望族知道這本書是一個(gè)偶然的機(jī)會(huì)修己，那段時(shí)間正好在研究免疫細(xì)胞比較厲害的團(tuán)隊(duì)工作（忝列門墻啊）迎罗，自然想找點(diǎn)資料來(lái)擴(kuò)充一下自己的知識(shí)面睬愤，以便知道T細(xì)胞到底有幾個(gè)正宗的亞群。如張老師對(duì)T...
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單細(xì)胞測(cè)序分析之Monocle2包學(xué)習(xí)筆記前一陣子練習(xí)了幾個(gè)單細(xì)胞測(cè)序分析纹安，然而對(duì)于所用的R包并沒有深入的學(xué)習(xí)尤辱。作為強(qiáng)迫癥晚期患者，想知其然厢岂，還想知其所以然光督，所以打算仔細(xì)的學(xué)習(xí)這些R包的使用。這篇文章將深入的學(xué)習(xí)Mo...
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monocle 2擬時(shí)序分析monocle做擬時(shí)序分析首先要構(gòu)建CDS需要3個(gè)矩陣：expr.matrix卒茬、pd船老、fd咖熟，其次將Seurat中的對(duì)象轉(zhuǎn)換為monocle識(shí)別的對(duì)象。然后選擇想要做擬時(shí)序依據(jù)...
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monocle分析及結(jié)果解讀1.寫在前面的話： 近年來(lái)柳畔，由于細(xì)胞的異質(zhì)性及發(fā)育分化等相關(guān)的問題越來(lái)越被研究者們所關(guān)注馍管，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析為研究異質(zhì)細(xì)胞群的復(fù)雜生物學(xué)過程提供了方法和工具。每一個(gè)細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)錄...
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趁熱打鐵--scRNA cell-type specific responses在前面盲人摸象--single cell sequencing的Seurat學(xué)習(xí)--詳細(xì)版這篇文章之后薪韩，我膨脹了确沸！感覺好想好想學(xué)習(xí)，因此俘陷，依據(jù)之前閱讀單細(xì)胞文獻(xiàn)的經(jīng)歷罗捎，將自己...
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周運(yùn)來(lái)宛逗，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥盾剩，穩(wěn)健雷激，瀟灑，大方告私，靠譜屎暇。一段生信緣，一棵技能樹驻粟。生信技能樹核心成員根悼，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者蜀撑，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家挤巡。
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R使用筆記: scatterplot with confidence ellipses;envfit的實(shí)現(xiàn)及釋意筆記內(nèi)容：用ggplot2繪制scatterplot with confidence ellipsesenvfit的R實(shí)現(xiàn)及釋意用ggpubr繪制scatterplot wi...
