使用susieR鑒定多個因果變異位點只需要兩個輸入文件瘩蚪,一個輸入文件是包含Zscore值的SNP位點(zscore.txt)锡宋,另一個文件是LD matrix(LD.matri...
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之前教程提到過Metal是可以做Meta分析辆飘,除了Metal雀鹃,PLINK也可以進行Meta分析坞笙。命令如下所示: 輸入文件gwas1.plink文件如下所示: 輸出結果如下所示...
基因型比值比(genotypic odds ratio)和等位基因比值比(allelic odds ratio)是兩個不同的概念闷供。一般而言,通過PLINK拳芙、GCTA等工具計算...
GWAS表型的標準化方法一般有Quantile normalization、Inverse rank normalization皮璧、Z-score normalization等...
GWAS:mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS) 分析mtag (Multi-Trait Analysis of GWAS)作用:通過對多個表型相似的GWAS summary結果進行聯(lián)合分析舟扎,發(fā)現(xiàn)更多的表型相關基因座。以抑郁癥狀...
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1、scDRS的計算原理如下所示: 圖片來源:Zhang M J, Hou K, Dey K K, et al. Polygenic enrichment distingui...
LDSC 除了可以計算基因多效性讯檐、遺傳度羡疗、遺傳相關性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQzMQ==&mid=224748...
本周最新文獻速遞20220522 一、精細解讀文獻 一 文獻題目: Single-nucleus chromatin accessibility profiling high...
本周最新文獻速遞20220515 一别洪、精細解讀文獻 一 文獻題目: Multi-ancestry genetic study of type 2 diabetes highl...
本周最新文獻速遞20220508 一叨恨、精細解讀文獻 一 文獻題目: Plasma proteome analyses in individuals of European a...
本周最新文獻速遞20220423 一、精細解讀文獻 一 文獻題目: Nonlinear control of transcription through enhancer–p...
圖片一直上傳失敗挖垛,需要看的親們請移步我的博客痒钝,同名:橙子牛奶糖
本周最新文獻速遞20220410本周最新文獻速遞20220410 一、精細解讀文獻 一 文獻題目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic bi...
本周最新文獻速遞20220410 一痢毒、精細解讀文獻 一 文獻題目: Mapping genomic loci implicates genes and synaptic bi...
本周最新文獻速遞20220327 一送矩、精細解讀文獻 一 文獻題目: Genetic regulation of post-translational modification...
本周最新文獻速遞20220313 一、精細解讀文獻 一 文獻題目: Prediction of histone post-translational modification...
本周最新文獻速遞20220306 一哪替、精細解讀文獻 一 文獻題目: Genome-wide analysis provides genetic evidence that A...
本周最新文獻速遞20220227 一栋荸、精細解讀文獻 一 文獻題目: Genetic associations of protein-coding variants in hu...
本周最新文獻速遞20220123 一、精細解讀文獻 一 文獻題目: Multi-ancestry eQTL meta-analysis of human brain iden...