發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山東
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完整轉(zhuǎn)錄組RNAseq分析流程（tophat2+cufflink+cuffdiff）前一段時(shí)間跟著孟浩巍大神的視頻學(xué)習(xí)睹酌，在自己的小破筆記本上還是跑完了整個(gè)RNAseq差異表達(dá)的分析流程（ tophat2 + cufflink + cuffdiff ）雖然這個(gè)...
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啟動(dòng)子預(yù)測(cè)軟件匯總
啟動(dòng)子預(yù)測(cè)軟件 Softberry：http://linux1.softberry.com/all.htm UCSC: http://genome.ucsc.edu/ EP...
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章憋沿。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程旺芽！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒(méi)有被我收入專題，可能是我沒(méi)看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見(jiàn)諒采章！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的运嗜，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq悯舟、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖担租、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl抵怎、R的包的使用過(guò)程 ?? 具體工具的使用奋救，比如GATK的使用過(guò)程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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G蛋白偶聯(lián)受體介導(dǎo)的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(Signalling transduction)：當(dāng)細(xì)胞膜上的受體感受外界信號(hào)刺激后反惕，將胞外信號(hào)通過(guò)跨膜結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)化為胞內(nèi)信號(hào)尝艘，并通過(guò)胞內(nèi)信使系統(tǒng)級(jí)聯(lián)放大信號(hào)以及蛋白質(zhì)...
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linux 查看磁盤剩余空間的命令不同于windows，linux查看硬盤剩余多少空間舷嗡，是通過(guò)命令查看轴猎。 Linux磁盤管理常用三個(gè)命令為df、du和fdisk进萄。df：列出文件系統(tǒng)的整體磁盤使用量du：檢查磁...
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【Linux】查看還剩余的內(nèi)存
服務(wù)器運(yùn)行的結(jié)果： 其中捻脖， free -h 適于可讀方式顯示內(nèi)存信息 free -g 以G為單位顯示 free -m 以M為單位顯示 free
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Hisat2的使用說(shuō)明一、比對(duì)原理 原文：HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. 摘要 1中鼠、Hisat是一種高效的R...
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菜鳥自學(xué)02：下載參考基因組及構(gòu)建bowtie2索引
把之前寫在CSDN的博文搬運(yùn)了過(guò)來(lái)可婶，集中記錄自己的學(xué)習(xí)過(guò)程。 1.下載參考基因組 根據(jù)文章里的“Data deposition: The sequence reported ...
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PSORT--蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)1惫搏、分析蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位有助于了解：蛋白質(zhì)功能和蛋白質(zhì)互作生物體細(xì)胞器類型：細(xì)胞核蛋白質(zhì)具温、線粒體蛋白質(zhì)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)筐赔、細(xì)胞膜铣猩、葉綠體蛋白質(zhì)、高爾基體2茴丰、通過(guò)生物信息學(xué)在線分...
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