想去這樣的實(shí)驗(yàn)室??冬念，圖源水印 需要下載兩個(gè)文件： cytoband文件 gencode注釋文件 用到的包： 文件下載到本地后扩氢，簡(jiǎn)單粗暴讀取 先對(duì) cytobandfile 做...
IP屬地：四川
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cytoband坐標(biāo)+gencode注釋一步get基因名 -
NCBI數(shù)據(jù)快速下載工具：aspera的安裝與使用
前言生物信息分析總是避不開從NCBI上下載數(shù)據(jù)反镇，但是很多時(shí)候通過瀏覽器登錄NCBI都費(fèi)勁毁涉，更別說下載大量的數(shù)據(jù)了昭卓。NR和NT數(shù)據(jù)庫(kù)是做序列比對(duì)經(jīng)常用到的數(shù)據(jù)庫(kù)下載鏈接： In...
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服務(wù)器配置個(gè)人R環(huán)境
大佬的文章：http://www.reibang.com/p/edaa744ea47d[http://www.reibang.com/p/edaa744ea47d] 菜雞...
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DNA甲基化數(shù)據(jù)分析全流程
2021-01-01 更新 簡(jiǎn)單記錄一下平時(shí)的分析過程 和RNA-seq前期流程類似 -- 質(zhì)控席揽、去接頭、比對(duì)參考基因組谓厘、排序 后期就是要提取甲基化位點(diǎn)幌羞，包括CpG、CHG竟稳、...
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如何獲得基因組CpG位點(diǎn)信息 —— Package：BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
簡(jiǎn)單的例子 運(yùn)行結(jié)果如下： 如此根據(jù)染色體序號(hào)循環(huán)即可得到保存整個(gè)基因組的CpG位點(diǎn)的RData属桦。 Biostrings BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg1...
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Stay hungry, Stay foolish
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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周運(yùn)來弹谁，男乾巧，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健预愤，瀟灑沟于，大方，靠譜植康。一段生信緣旷太，一棵技能樹。生信技能樹核心成員销睁，單細(xì)胞天地供稿人供璧，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家冻记。
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搬磚的工人<br>
