想去這樣的實(shí)驗(yàn)室??厢破，圖源水印 需要下載兩個(gè)文件： cytoband文件 gencode注釋文件 用到的包： 文件下載到本地后督笆，簡單粗暴讀取 先對(duì) cytobandfile 做...
IP屬地：云南
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cytoband坐標(biāo)+gencode注釋一步get基因名 -
NCBI數(shù)據(jù)快速下載工具：aspera的安裝與使用
前言生物信息分析總是避不開從NCBI上下載數(shù)據(jù)，但是很多時(shí)候通過瀏覽器登錄NCBI都費(fèi)勁，更別說下載大量的數(shù)據(jù)了帅韧。NR和NT數(shù)據(jù)庫是做序列比對(duì)經(jīng)常用到的數(shù)據(jù)庫下載鏈接： In...
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服務(wù)器配置個(gè)人R環(huán)境
大佬的文章：http://www.reibang.com/p/edaa744ea47d[http://www.reibang.com/p/edaa744ea47d] 菜雞...
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DNA甲基化數(shù)據(jù)分析全流程
2021-01-01 更新 簡單記錄一下平時(shí)的分析過程 和RNA-seq前期流程類似 -- 質(zhì)控膏孟、去接頭缴饭、比對(duì)參考基因組、排序 后期就是要提取甲基化位點(diǎn)骆莹，包括CpG颗搂、CHG、...
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如何獲得基因組CpG位點(diǎn)信息 —— Package：BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
簡單的例子 運(yùn)行結(jié)果如下： 如此根據(jù)染色體序號(hào)循環(huán)即可得到保存整個(gè)基因組的CpG位點(diǎn)的RData幕垦。 Biostrings BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg1...
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Stay hungry, Stay foolish
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中山大學(xué)中山醫(yī)學(xué)院-基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)博士在讀<br>歡迎關(guān)注個(gè)人公眾號(hào)<br><br>公眾號(hào)：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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周運(yùn)來氯庆，男蹭秋，長大了才會(huì)遇到的帥哥扰付，穩(wěn)健，瀟灑仁讨，大方羽莺，靠譜。一段生信緣洞豁，一棵技能樹禽翼。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人族跛，簡書創(chuàng)作者闰挡，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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搬磚的工人<br>
