這兩夜都有夢見奶奶纵穿，但沒有以前那么清晰，好像本來陰陽兩間都是存在的轩缤，可是互相往來不能留下太多的憑證臀脏，或許是知道我開始把這些東西記錄下來渤滞，有公之于眾的風(fēng)險纱兑。 第一晚： 好像是讀...
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Wray2019 復(fù)雜性狀預(yù)測 綜述
Wray NR, Kemper KE, Hayes BJ, et al. Complex Trait Prediction from Genome Data: Contras...
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收藏數(shù)量遺傳學(xué)和生物統(tǒng)計學(xué)知識
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基因組組裝實踐練習(xí)此博客是對列日大學(xué)Marc HANIKENNE的Practical Genomics 課程的總結(jié)， 并且我將其分為四個部分：第一部分：測序數(shù)據(jù)的質(zhì)控和過濾第二部分：遺傳var...
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利用基因組信息改善牲畜 -綜述（2019）閱讀Michel Georges綜述的筆記综芥。這邊綜述從家畜物種（即牛丽蝎、綿羊、山羊膀藐、豬屠阻、家禽和鮭魚）的可用基因組資源的狀況，以及如何使用這些資源來加速缺陷致病基因的發(fā)現(xiàn)和管理消请，...
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從遺傳關(guān)聯(lián)到基因：方法苞七、應(yīng)用和挑戰(zhàn) (綜述)重點 將全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 與分子數(shù)量性狀位點 (xQTL)（包括背景依賴性 (cd)-xQTL）跨多個組學(xué)水平相結(jié)合藐守，有助于揭示 GWAS 信號背后的假定因果基...
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主要用來收集一些與動物數(shù)量遺傳相關(guān)的文章卢厂，包括新穎表型預(yù)測和算法應(yīng)用于此領(lǐng)域，同時惠啄，一些常用軟件及其使用方法也包括在內(nèi)慎恒。
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基于參考基因組的基因組組裝和注釋
將基因組組裝到染色體水平無非就是兩種方式： 獨立組裝（de novo）； 基于參考基因組的組裝（reference-guided）趋距，即基于近緣或同一物種的基因組染色體同源性進...
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ROH分析及熱點區(qū)域計算0寫在前面 腳本方面充斥著CHATGPT粒氧，復(fù)制粘貼。盡管每個步驟都實際運行過棚品，但因為是一邊實驗一邊寫靠欢，難免存在錯誤各種排版，細節(jié)問題懶得細摳了這篇文章又被鎖定了 1.文件處理...
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bcftools 處理vcf文件铜跑，尋找多個vcf文件中突變的交集
目標(biāo) 通過varscan等找到somatic mutations之后门怪，想看多個樣本的突變之間的交集。bcftools是用來處理vcf文件锅纺，可以進行各種相關(guān)的處理和分析掷空。 軟件...
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如何從多個文件中取交集？
比如我有很多個文件（100或者1000個以上）囤锉，每一個文件都包含兩列信息坦弟，一列是染色體的位置信息，一列是它對應(yīng)的值官地，但是這些文件的行數(shù)不完全一樣酿傍。如果我想快速的找到所有文件的...
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GWAS分析-說人話（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來到這里你辣，已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計這輩子我也沒有想到，我把我最厭惡的東西寫出來尘执， 居然是最多人看的...... 分析方法很多舍哄，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼，大神請...
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我是外科醫(yī)生，所以很粗暴的喲炉旷！～～<br>歡迎大家關(guān)注微博“醫(yī)學(xué)小蛋散”哦～<br>讓學(xué)醫(yī)快樂～ <br>記錄行醫(yī)之旅～
