這兩夜都有夢(mèng)見奶奶瘤缩，但沒有以前那么清晰较解，好像本來陰陽兩間都是存在的斤讥，可是互相往來不能留下太多的憑證聚蝶，或許是知道我開始把這些東西記錄下來鲜锚，有公之于眾的風(fēng)險(xiǎn)晴楔。 第一晚： 好像是讀...
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Wray2019 復(fù)雜性狀預(yù)測(cè) 綜述
Wray NR, Kemper KE, Hayes BJ, et al. Complex Trait Prediction from Genome Data: Contras...
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收藏?cái)?shù)量遺傳學(xué)和生物統(tǒng)計(jì)學(xué)知識(shí)
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基因組組裝實(shí)踐練習(xí)此博客是對(duì)列日大學(xué)Marc HANIKENNE的Practical Genomics 課程的總結(jié)沧踏， 并且我將其分為四個(gè)部分：第一部分：測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)控和過濾第二部分：遺傳var...
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利用基因組信息改善牲畜 -綜述（2019）閱讀Michel Georges綜述的筆記。這邊綜述從家畜物種（即牛巾钉、綿羊翘狱、山羊、豬砰苍、家禽和鮭魚）的可用基因組資源的狀況潦匈，以及如何使用這些資源來加速缺陷致病基因的發(fā)現(xiàn)和管理，...
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從遺傳關(guān)聯(lián)到基因：方法昵济、應(yīng)用和挑戰(zhàn) (綜述)重點(diǎn) 將全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 與分子數(shù)量性狀位點(diǎn) (xQTL)（包括背景依賴性 (cd)-xQTL）跨多個(gè)組學(xué)水平相結(jié)合，有助于揭示 GWAS 信號(hào)背后的假定因果基...
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主要用來收集一些與動(dòng)物數(shù)量遺傳相關(guān)的文章，包括新穎表型預(yù)測(cè)和算法應(yīng)用于此領(lǐng)域斯稳，同時(shí)海铆，一些常用軟件及其使用方法也包括在內(nèi)。
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基于參考基因組的基因組組裝和注釋
將基因組組裝到染色體水平無非就是兩種方式： 獨(dú)立組裝（de novo）憎茂； 基于參考基因組的組裝（reference-guided）珍语，即基于近緣或同一物種的基因組染色體同源性進(jìn)...
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ROH分析及熱點(diǎn)區(qū)域計(jì)算0寫在前面 腳本方面充斥著CHATGPT，復(fù)制粘貼竖幔。盡管每個(gè)步驟都實(shí)際運(yùn)行過板乙，但因?yàn)槭且贿厡?shí)驗(yàn)一邊寫，難免存在錯(cuò)誤各種排版拳氢，細(xì)節(jié)問題懶得細(xì)摳了這篇文章又被鎖定了 1.文件處理...
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bcftools 處理vcf文件募逞，尋找多個(gè)vcf文件中突變的交集
目標(biāo) 通過varscan等找到somatic mutations之后蛋铆，想看多個(gè)樣本的突變之間的交集。bcftools是用來處理vcf文件放接，可以進(jìn)行各種相關(guān)的處理和分析刺啦。 軟件...
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如何從多個(gè)文件中取交集？
比如我有很多個(gè)文件（100或者1000個(gè)以上）透乾，每一個(gè)文件都包含兩列信息洪燥，一列是染色體的位置信息，一列是它對(duì)應(yīng)的值乳乌，但是這些文件的行數(shù)不完全一樣捧韵。如果我想快速的找到所有文件的...
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GWAS分析-說人話（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來到這里，已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計(jì)這輩子我也沒有想到扳抽，我把我最厭惡的東西寫出來篡帕， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼贸呢，大神請(qǐng)...
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我是外科醫(yī)生楞陷，所以很粗暴的喲怔鳖！～～<br>歡迎大家關(guān)注微博“醫(yī)學(xué)小蛋散”哦～<br>讓學(xué)醫(yī)快樂～ <br>記錄行醫(yī)之旅～
