這兩夜都有夢見奶奶俊扭，但沒有以前那么清晰刚操，好像本來陰陽兩間都是存在的突想，可是互相往來不能留下太多的憑證恋昼，或許是知道我開始把這些東西記錄下來猎荠，有公之于眾的風險娱俺。 第一晚： 好像是讀...
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Wray2019 復雜性狀預測 綜述
Wray NR, Kemper KE, Hayes BJ, et al. Complex Trait Prediction from Genome Data: Contras...
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收藏數(shù)量遺傳學和生物統(tǒng)計學知識
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利用基因組信息改善牲畜 -綜述（2019）閱讀Michel Georges綜述的筆記邢笙。這邊綜述從家畜物種（即牛、綿羊侍匙、山羊氮惯、豬叮雳、家禽和鮭魚）的可用基因組資源的狀況，以及如何使用這些資源來加速缺陷致病基因的發(fā)現(xiàn)和管理妇汗，...
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從遺傳關(guān)聯(lián)到基因：方法娘扩、應(yīng)用和挑戰(zhàn) (綜述)重點 將全基因組關(guān)聯(lián)研究 (GWAS) 與分子數(shù)量性狀位點 (xQTL)（包括背景依賴性 (cd)-xQTL）跨多個組學水平相結(jié)合，有助于揭示 GWAS 信號背后的假定因果基...
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主要用來收集一些與動物數(shù)量遺傳相關(guān)的文章，包括新穎表型預測和算法應(yīng)用于此領(lǐng)域猜绣，同時灰殴，一些常用軟件及其使用方法也包括在內(nèi)。
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基于參考基因組的基因組組裝和注釋
將基因組組裝到染色體水平無非就是兩種方式： 獨立組裝（de novo）尸变； 基于參考基因組的組裝（reference-guided）义图，即基于近緣或同一物種的基因組染色體同源性進...
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ROH分析及熱點區(qū)域計算0寫在前面 腳本方面充斥著CHATGPT，復制粘貼召烂。盡管每個步驟都實際運行過碱工，但因為是一邊實驗一邊寫，難免存在錯誤各種排版奏夫，細節(jié)問題懶得細摳了這篇文章又被鎖定了 1.文件處理...
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bcftools 處理vcf文件怕篷，尋找多個vcf文件中突變的交集
目標 通過varscan等找到somatic mutations之后，想看多個樣本的突變之間的交集酗昼。bcftools是用來處理vcf文件廊谓，可以進行各種相關(guān)的處理和分析。 軟件...
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如何從多個文件中取交集麻削？
比如我有很多個文件（100或者1000個以上）蒸痹，每一個文件都包含兩列信息春弥，一列是染色體的位置信息，一列是它對應(yīng)的值叠荠，但是這些文件的行數(shù)不完全一樣匿沛。如果我想快速的找到所有文件的...
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GWAS分析-說人話（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來到這里腿准，已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計這輩子我也沒有想到际起，我把我最厭惡的東西寫出來， 居然是最多人看的...... 分析方法很多吐葱，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼街望，大神請...
