運(yùn)行GATK時(shí)，報(bào)錯(cuò)：java.lang.IllegalArgumentException: samples cannot be empty這個(gè)問題在GATK Forum有...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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GATK - Read groups
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fastq序列質(zhì)量Q30統(tǒng)計(jì)軟件
FaQCs 使用perl編寫知染，R畫圖。不僅可以統(tǒng)計(jì)質(zhì)量，Q30罪佳，還可以trim序列杯道。安裝簡(jiǎn)單準(zhǔn)備好兩個(gè)需要的perl 模塊,下載github上的文件澡绩，然后直接cd lib;....
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使用busco進(jìn)行基因組質(zhì)量評(píng)估BUSCO是一款使用python語(yǔ)言編寫的對(duì)轉(zhuǎn)錄組和基因組組裝質(zhì)量進(jìn)行評(píng)估的軟件列疗。在相近的物種之間總有一些保守的序列滑蚯，而BUSCO就是使用這些保守序列與組裝的結(jié)果進(jìn)行比對(duì)，鑒...
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啥時(shí)候能賺到100萬(wàn)作彤？
疫情突然襲來膘魄，好多實(shí)體店都關(guān)門了，原準(zhǔn)備也盤個(gè)店做點(diǎn)啥生意賺點(diǎn)錢呢竭讳，三年的疫情，現(xiàn)在沒有膽量去盤店了浙踢，深怕自己攜帶全家陷入泥潭無法自拔绢慢，還是保守點(diǎn)好了。 那么話說回來了洛波，保守...
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生物信息軟件/流程dockerfile打包參考
生信軟件胰舆、流程依賴的東西太多，docker打包鏡像一不小心就是上Gb大小蹬挤。 鏡像太大很多缺點(diǎn)：上傳缚窿、拉取慢；費(fèi)寬帶焰扳；占空間倦零。。吨悍。 docker已廣泛應(yīng)用在IT扫茅，生信只是沾了點(diǎn)...
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微生物群落的安娜·卡列尼娜原則AKP預(yù)測(cè)微生物對(duì)擾動(dòng)的反應(yīng)是微生物學(xué)的一個(gè)基本挑戰(zhàn)。大多數(shù)關(guān)于微生物組動(dòng)力學(xué)的研究都集中于研究微擾使動(dòng)物微生物群從健康狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榉墙】捣€(wěn)定狀態(tài)的模式育瓜。 本文提出了另一種設(shè)想葫隙，即許...
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canu 組裝PacBio數(shù)據(jù)
基因組組裝的三個(gè)層次，contig, scaffold和chromosomes.contig表示從大規(guī)模測(cè)序得到的短讀(reads)中找到的一致性序列躏仇。組裝的第一步就是從短片...
