results[[2]][["consensusClass"]]就是樣本分成2簇的信息
一致性聚類ConsensusClusterPlus介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法赁咙,例如作為微陣列基因表達。這種方法在癌癥基因組學中得到了廣泛應用免钻,在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類彼水。 ...
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一致性聚類ConsensusClusterPlus介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法赁咙,例如作為微陣列基因表達。這種方法在癌癥基因組學中得到了廣泛應用免钻,在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類彼水。 ...
您的分享很詳細,幫助挺大氛琢,謝謝
R語言ggboxplot-一文掌握箱線圖繪制所有細節(jié)作者:白介素2相關閱讀:R語言ggplot2繪制箱線圖R語言生存分析04-Cox比例風險模型診斷R語言生存分析03-Cox比例風險模型R語言生存分析-02-ggforestR...
看到樓上已評論了阳似,嘻嘻骚勘,其實就是add=“”,這個參數(shù)來設置是否顯示點點,不想顯示就#掉這個參數(shù)即可
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你好瓢娜,我想請教您一個問題驱证。readLength這個參數(shù)后邊接的是質(zhì)控后fastq文件中reads的長度還是測序的reads長度?恋腕?謝謝啦
2019-08-29 rMATS找可變剪切與可視化python /media/shen/disk1/biosoft/rMATS.4.0.3beta/rMATS-turbo-Linux-UCS4/rmats.py --b1 m...
@劉小澤 好的抹锄,謝謝
利用linux處理fq/fa小練習劉小澤寫于19.1.11知識就是這樣,越用越熟練荠藤,像awk伙单、grep、sed等哈肖,用時間長了就有感覺了吻育;另外所有我們遇到的問題都能搜索到,所以不用擔心辦法解決這份題不是我出的淤井,...
你好布疼,有沒有方法能把FQ格式文件數(shù)據(jù)的前50bp提取出來,并保持數(shù)據(jù)完整性呢币狠?
利用linux處理fq/fa小練習劉小澤寫于19.1.11知識就是這樣游两,越用越熟練,像awk漩绵、grep贱案、sed等,用時間長了就有感覺了止吐;另外所有我們遇到的問題都能搜索到宝踪,所以不用擔心辦法解決這份題不是我出的,...
你好碍扔,我想請教一下瘩燥,,做偽時間的輸入文件是啥樣的不同?
Monocle擬時間分析Monocle可以進行下面三種類型的分析厉膀,可以與seurat無縫連接: 1 對細胞進行聚類、分組和計算;2.進行擬時間分析站蝠;3.差異表達分析汰具; 2.Constructing ...
(不是軟文留荔,真實經(jīng)歷) 萬萬沒想到,在踏入PAIR的辦公室那一天澜倦,竟然是將我人生軌跡扭轉(zhuǎn)的開始聚蝶。 我是一名來自中山大學的標準中等生,攻讀生物技術(shù)專業(yè)藻治,GPA在三等獎邊緣來回試...
@MC學公衛(wèi) 對對對碘勉,我剛問了師兄,他也說是版本問題
實驗記錄3:用R包Seurat進行QC桩卵、PCA分析與t-SNE聚類版本信息: Seurat v2.0不是3.0验靡!現(xiàn)在Seurat更新了3.0版本,下載也是默認的3.0雏节,這篇記錄只適用于用2.0的胜嗓。 梗概 將Cellranger中的基因表達矩...
32738個基因,2700個細胞(其實就是hg19這個人的單細胞測序數(shù)據(jù))另外有個問題:matrix.mtx文件的第一列是什么信息钩乍?
實驗記錄3:用R包Seurat進行QC辞州、PCA分析與t-SNE聚類版本信息: Seurat v2.0不是3.0!現(xiàn)在Seurat更新了3.0版本寥粹,下載也是默認的3.0变过,這篇記錄只適用于用2.0的。 梗概 將Cellranger中的基因表達矩...