導 讀 本章介紹T細胞的抗原識別分子，即T細胞受體（TCR）椎咧。上圖概述了TCR組裝的主要步驟蛾洛。如第2章所述，TCRs識別肽抗原有一個必要條件彤侍，那就是該抗原需要由自身主要組織相...
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第7章：T細胞受體(TCR)概述2021-04-17 -
單細胞Seurat V5分析流程自從seurat V5更新之后呢，很多小伙伴，初學者居多吧食拜，都有點不適應，再加上網(wǎng)上有些人的“煽風點火”副编，導致大家望而卻步负甸，好像這次更新非常可怕一樣痹届。其實不然呻待，seurat的...
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Seurat的三種單細胞數(shù)據(jù)整合方法匯總（批次校正）2022-05-24
關鍵詞 批次效應 批次校正 單細胞數(shù)據(jù)整合 適用背景 單細胞數(shù)據(jù)由于實驗平臺或樣本等原因會造成不同數(shù)據(jù)集之間存在批次效應，這種批次效應是人為因素造成的队腐，沒有實際的生物學意義带污，...
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2021-05-23 ChIP-seq數(shù)據(jù)從頭到尾比對及分析匯總（個人分析記錄貼）0_1 前言 有時間再詳細寫introduction。先把我分析數(shù)據(jù)的流程記錄下來香到，后續(xù)持續(xù)更新鱼冀。 0_2 用到的軟件或腳本 測序數(shù)據(jù)質控：fastp[https://git...
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如何提取ATAC-seq數(shù)據(jù)的差異peaks?（DiffBind包的使用）2021年開年第一篇筆記~ 這篇筆記主要記錄DiffBind包的學習。在很久以前我寫過一篇ATAC-seq分析流程（ATAC-seq分析練習[https://www.jian...
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ChIP-seq實踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關基因的GO分析)在實踐之前悠就，我先查找了一下有關組蛋白修飾的知識點：（參考文章：http://www.reibang.com/p/8aca72809c5c） 組蛋白修飾能預測染色質的類型（異...
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一文讀懂 ChIPseq
一千绪、介紹 ChIP-seq，測序方法ChIP 指染色質免疫共沉淀技術（Chromatin Immunoprecipitation梗脾，ChIP）荸型，seq 指的是二代測序方法 作用...
