基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)抵赢，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成臼寄。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因噪伊，是遺傳變異一個(gè)非常重要的來(lái)源推盛，...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全 -
做一個(gè)自由而有用的靈魂<br>
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小麥網(wǎng)頁(yè)版分析KEGG和GO一柜砾、KEGG分析 通過(guò)這篇文章上的網(wǎng)站進(jìn)行小麥的KEGG分析 1）點(diǎn)擊analyze data 2）粘貼自己的基因名稱數(shù)據(jù) 3）提交數(shù)據(jù)并進(jìn)行分析 4）查看mapping到的...
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群體選擇信號(hào)分析群體進(jìn)化與選擇信號(hào)：●生活在世界不同區(qū)域的生物群體在歷史長(zhǎng)河中經(jīng)歷千萬(wàn)年的自然選擇、人工馴化践瓷、遷徙院喜、遺傳漂變等事件的洗禮，有的物種滅絕晕翠，有的物種分化出不同的亞種或亞群,甚至逐...
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植物圖形泛基因組Graph-based pan-genome圖形泛基因組（圖泛）以節(jié)點(diǎn)和路徑的形式存儲(chǔ)和展示物種的變異信息喷舀，關(guān)鍵作用是擴(kuò)展線性參考基因組的坐標(biāo)系統(tǒng)，以容納更多的遺傳多樣性區(qū)域淋肾。本文首先總結(jié)了圖泛構(gòu)建方法硫麻，然后討論了圖泛...
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暫別簡(jiǎn)書，后會(huì)有期
我不是老師樊卓，也不是大神拿愧，更不是前輩。我只是個(gè)普通的科研工作者简识，一個(gè)只想努力變得更好的人赶掖。 來(lái)到簡(jiǎn)書快3年了感猛，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙纳萋浮Ｖ两?..
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GO-plot:超好看的GO富集可視化以下代碼均來(lái)自GO-plot的manual（GOplot (wencke.github.io)[https://wencke.github.io/]）膳灶。GO-plot用條形圖...
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蕪湖轧钓，我又回來(lái)了序厉，和坐過(guò)山車一樣
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群體適應(yīng)性分析——選擇信號(hào)●選擇信號(hào)：生物在自然選擇或人工選擇過(guò)程中，由于選擇作用在基因組上留下的遺傳多態(tài)性降低毕箍、連鎖不平衡等選擇印記弛房。●選擇性清除（selective sweep）：受選擇基因座位的...
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基于單體型haplotypes的群體選擇信號(hào)的檢測(cè)——EHH & iHS
基于單體型haplotype的選擇信號(hào)的檢測(cè)而柑。在selective sweeps選擇過(guò)程中文捶，有些強(qiáng)烈受到選擇的位點(diǎn)variants由于LD的因素會(huì)連帶著其附近的位點(diǎn)varia...
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R繪圖：ggplot2繪制火山圖火山圖是測(cè)序分析報(bào)告中最為核心的圖片之一。繪制火山圖的方法有許多媒咳，Excel和第三方軟件等粹排，本文主要運(yùn)用ggplot2和ggrepel兩個(gè)R包演示[1][2]。橫坐標(biāo)為Fol...
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昆蟲學(xué)博士，分享實(shí)驗(yàn)Protocol妙同、生物信息射富、科研繪圖、中國(guó)傳統(tǒng)術(shù)數(shù)學(xué)等渐溶。
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我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年茎辐，我開(kāi)始自學(xué)生物信息宪郊，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)拖陆，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記弛槐。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
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@26dfe547c084 分子標(biāo)記數(shù)據(jù)依啰，可以看看QTL定位相關(guān)的軟件乎串。
GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析：TASSEL 5.0 Windows版軟件使用教程
TASSEL的官方網(wǎng)站：https://tassel.bitbucket.io/[https://tassel.bitbucket.io/]在TASSEL的下載文件夾中......
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@2b13d4e31a3c https://tassel.bitbucket.io/ 在這里應(yīng)該可以下載
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@曉曉_71d9 CMplot、qqman等很多包都可以繪制曼哈頓圖速警，軟件的說(shuō)明中有很詳細(xì)的代碼叹誉。
GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析：TASSEL 5.0 Windows版軟件使用教程
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堆積柱形圖（stacked barplot）展示密碼子偏向性的RSCU值研究密碼子偏向性的論文通常都會(huì)分析RSCU值鸯两，論文中通常會(huì)用堆積柱形圖來(lái)展示RSCU的值，之前在論文里也看到過(guò)下面這幅圖的形式展示RSCU分析的結(jié)果 之前也有人在公眾號(hào)留言問(wèn)...
