發(fā)簡信
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組間差異檢驗阻课，終于有人講清楚了!什么是組間差異檢驗？就是組間的差異分析以及顯著性檢驗蕾各，應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)上的假設(shè)檢驗方法，檢驗組間是否有差異及其差異程度弹砚。坦率地講迟蜜，所有的差異檢驗都基于一個假設(shè)：組間沒有差異，變量之...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心听绳，又辜負了努力
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一些生物信息學(xué)用到的軟件祝辣，工具贴妻，介紹用法安裝以及以及應(yīng)用的文章 ?? 測序組裝使用的Spades、canu等等 ?? 序列比對比如blast蝙斜、bowtie名惩、diamond等 ?? 多序列比對比如mega、clustalW孕荠、matff等 ?? 序列格式轉(zhuǎn)化的samtools娩鹉、bedtools等等 ?? 可變剪接分析的rMATS攻谁、MISO ?? 微衛(wèi)星序列查找工具misa等 ?? call peak的工具macs2 ?? 文獻下載工具Sci-hub桌面版 ?? 進化樹構(gòu)建工具IQtree、ggtree等 ?? 同源基因查找工具OrthoMCL弯予、OrthoFinder等 ?? 尋找測序中的結(jié)構(gòu)變異或者SNP序列GATK戚宦、bcftools等 ?? 宏基因組組裝與分析的anvi'o、QIMME ?? 測序質(zhì)量評估的FastQC锈嫩、BUSCO受楼、QUAST ?? 可視化工具比如IGV、3D Genome ?? 測序數(shù)據(jù)下載工具SRA Toolkit呼寸、ascp等 ?? 數(shù)據(jù)可視化的工具circos 等等
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