這里是佳奧<br><br>有疑問歡迎email或yuque平臺<br><br>專注多組學(xué)挖掘基因，以及非模式植物的下游注釋以及可視化工作
IP屬地：江西
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lncRNA,miRNA,mRNA互作通過lncRNA獲得結(jié)合的miRNA（3個miRNA預(yù)測數(shù)據(jù)庫中都存在）稚补，再獲得miRNA作用的靶基因mRNA柬泽，靶基因mRNA與任一腫瘤差異mRNA取交集慎菲，交集mRNA與其相...
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跟著NC學(xué)作圖 | 差異比較小提琴+柱狀組合圖關(guān)于小提琴圖和柱狀圖的繪制教程很多露该，在我們前面的教程中也推送過，大家感興趣的可以去看一下第煮。今天解幼，我們繼續(xù)小提琴+柱狀圖的組合圖，且繪制出差異標識包警。 繪圖 數(shù)據(jù)準備 數(shù)據(jù)根據(jù)自...
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一文帶你讀懂單細胞測序本文首發(fā)于“生信大碗”公眾號撵摆，轉(zhuǎn)載請注明出處 單細胞測序技術(shù)自2009年湯富酬老師發(fā)表單細胞文獻后被廣泛了解，2013年被Nature Methods評為年度技術(shù)害晦，至此越來越...
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Meta分析怎么做壹瘟？手把手教你7步學(xué)會Meta分析鲫剿！Meta分析一對一指導(dǎo)，符合學(xué)術(shù)規(guī)范稻轨，結(jié)課直接投稿灵莲，+tjzgBL喲！ 醫(yī)學(xué)不做實驗也能輕輕松松發(fā)SCI 殴俱，是不是覺得很神奇政冻！學(xué)姐今天就把“秘訣”傳授給大家！想必很多科研小白...
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專注于醫(yī)學(xué)統(tǒng)計、臨床研究等優(yōu)質(zhì)科研課程的輸出及一對一培訓(xùn)询筏。免費加入統(tǒng)計之光VIP榕堰，每年預(yù)計免費學(xué)習(xí)60+精品筑基科研課程！
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森林圖可視化Cox回歸的結(jié)果今天畫森林圖我之前明明學(xué)會了來著嫌套，但是一年沒用現(xiàn)在又忘記了逆屡，人老了，唉踱讨！還是寫個筆記好魏蔗。這里以一篇文獻里面的森林圖為例(PMID: 34285580）。 1. 首先準備以上文...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘（四）使用STRING數(shù)據(jù)庫進行PPI分析首先準備好前面分析的差異基因痹筛，進入STRING數(shù)據(jù)庫分析頁面：https://cn.string-db.org/[https://cn.string-db.org/] 第一步...
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maftools包分析突變數(shù)據(jù)砌们，繪制瀑布圖前面給大家介紹了MAF文件格式 ? MAF格式（mutation annotation format）[https://link.zhihu.com/?target=http...
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R語言~高級PCA分析主成分分析，不只需要找到幾個虛擬但不知具體為何物的主成分因子搁进，還需要知道我們提供的變量在各個主成分因子上的載荷（有正有負）和貢獻度浪感，以及具體保留多少個主成分因子才能既盡量保留...
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生信常用分析圖形繪制02 -- 解鎖火山圖真諦！有了R語言的基礎(chǔ)饼问，以及ggplot2繪圖基礎(chǔ)影兽，我們的生信常用分析圖形的繪制就可以提上日程了！本系列匆瓜，師兄就開始帶著大家一起學(xué)習(xí)如何用R語言繪制我們自己的各種分析圖吧赢笨！ 由于本...
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R可視化——Mantel test分析及可視化????此前我們已經(jīng)講過了如何使用R語言計算兩列數(shù)據(jù)相關(guān)性的分析方法，今天驮吱，我們來看一種檢驗兩個矩陣相關(guān)關(guān)系的方法——Mantel test方法茧妒，這種分析方法可用在植物微生物...
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RNA-seq： 用perl進行基因ID轉(zhuǎn)換RNAseq上游分析得到的矩陣通常是如下的基因id，這對于我們找差異基因不夠直觀左冬，所以做差異分析之前一般會進行一個基因id轉(zhuǎn)換桐筏。 輸入文件 即轉(zhuǎn)換為這種格式，方法如下拇砰。 輸出...
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2022新版TCGA數(shù)據(jù)下載與整理2022年4月份TCGA進行了更新梅忌，測序數(shù)據(jù)變成了STAR-count文件。以往count文件是htseq.counts.gz格式除破，現(xiàn)在變成star_gene_counts....
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R-論文三線表快速實現(xiàn)-update經(jīng)常在報道基線資料時候牧氮，會設(shè)計表格，需要摘錄統(tǒng)計結(jié)果瑰枫，非常麻煩的調(diào)整表格踱葛。今天本文章利用compareGroups就解決這樣的問題。 今天就來介紹一個簡單有效的數(shù)據(jù)整理成表格...
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一網(wǎng)打盡GEO數(shù)據(jù)集全目錄信息1 GEO菜單初覽 1.1 GDS目錄 1.2 GPL目錄 1.3 GSE目錄 1.4 GSM目錄 2 使用R包rvest下載GEO菜單 2.1 以GPL數(shù)據(jù)的一個頁面為例 ...
