一迟蜜、巨噬細(xì)胞 1. Cre工具鼠 Cre工具鼠是通過在小鼠marker基因位點(diǎn)敲入Cre/CreERT2或者Dre/DreERT2元件構(gòu)建而成橄妆。Cre工具鼠跟特定的flox小...
IP屬地：海南
-
髓系細(xì)胞工具鼠匯總
-
答讀者問(8)：如何批量查詢marker基因(對應(yīng)的蛋白)會(huì)不會(huì)在膜上表達(dá)？做實(shí)驗(yàn)的朋友們對這個(gè)問題應(yīng)該是很感興趣的盟蚣，因?yàn)樯婕暗胶罄m(xù)能不能實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證涕蚤。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文獻(xiàn)三妈，查網(wǎng)站丧荐。我知道的：uniprot、PDB翻伺、the human...
-
聽說你想要TCGA的新版miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)
TCGA的下載方式更新了材泄，miRNA也跟著動(dòng)一下。 1.查看TCGA的33個(gè)癌種 2.下載數(shù)據(jù) 使用的是TCGAbiolinks里面的函數(shù)吨岭，受網(wǎng)絡(luò)限制拉宗，有可能下載不成功。 3...
-
Tangram 空間轉(zhuǎn)錄組教程（二）前文提到Tangram在基于mapping的步驟辣辫，有兩種方式: mode = "cluster"：速度快旦事，占用內(nèi)存少，適用于空轉(zhuǎn)和單細(xì)胞數(shù)據(jù)來自不同樣本情況下急灭。 mode =...
-
Tangram 空間轉(zhuǎn)錄組教程（一）什么是tangram姐浮？ tangram是一種映射單細(xì)胞表達(dá)譜數(shù)據(jù)到空間表達(dá)譜的方法，它收集同一解剖區(qū)域或者組織類型的單細(xì)胞數(shù)據(jù)和空間數(shù)據(jù)葬馋。通過整合卖鲤，該方法在scRNAseq表...
-
膠質(zhì)母細(xì)胞瘤免疫亞型分析+免疫組化發(fā)8+分SCI今天給大家介紹一篇2022年1月發(fā)表在OncoImmunology（IF:8.110）上的一篇文章。本研究作者對單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和bulk轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析畴嘶，鑒定到了一個(gè)新的G...
-
TCGA的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性數(shù)據(jù)獲取和可視化1.背景知識(shí) 在一篇文章里看到了微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（Microsatellite Instability蛋逾，MSI）與riskscore的關(guān)系圖，就去查了一下窗悯，很好的背景知識(shí)資料：...
-
空間轉(zhuǎn)錄組之空間基因和細(xì)胞軌跡作者区匣，追風(fēng)少年i~ hello，又是一周蒋院，新的開始亏钩，今天的內(nèi)容簡單，邏輯圖如下 大家可以看的出來悦污，空間轉(zhuǎn)錄組運(yùn)用的是BGI平臺(tái)铸屉，Stereo-seq钉蒲，研究的重點(diǎn)就是空間區(qū)域的...
