隨著測序成本的不斷下降付鹿，轉(zhuǎn)錄組測序分析已然成為生物學(xué)及醫(yī)學(xué)研究不可或缺的技術(shù)手段。 但是须妻，對于大多數(shù)初學(xué)者來說处铛，會遇到各種各樣的問題错蝴。這里果覆，小編就給大家重點(diǎn)介紹一下轉(zhuǎn)錄組測序...
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20個(gè)轉(zhuǎn)錄組知識點(diǎn)-你必須知道政鼠！
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LD值（連鎖不平衡）
連鎖不平衡(Linkage disequilibrium)又稱等位基因關(guān)聯(lián)（allelic association），其原理其實(shí)很簡單夫否。 假定兩個(gè)緊密連鎖的位點(diǎn)1彻犁，2，各有兩...
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qRT-PCR相對定量計(jì)算詳解做完轉(zhuǎn)錄組分析之后凰慈，一般都要求做qRT-PCR來驗(yàn)證二代測序得到的轉(zhuǎn)錄本表達(dá)是否可靠汞幢。熒光定量PCR是一種相對表達(dá)定量的方法，他的計(jì)算方法有很多微谓，常用的相對定量數(shù)據(jù)分析方法有...
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轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果閱讀指南測序容易森篷，解讀困難 現(xiàn)在大部分同學(xué)做轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)都是讓測序公司去分析，經(jīng)過了那么多年的發(fā)展堰酿，公司提供的分析結(jié)果也是越來越豐富了疾宏，光結(jié)題報(bào)告就有幾十頁，結(jié)果文件有幾百兆甚至超過1...
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木薯抗性NBS基因家族分析
雖然我們一直在說可以“用別人的數(shù)據(jù)触创，寫自己的文章”坎藐，但是具體怎么操作，很多同學(xué)還是不清楚哼绑。今天就用一個(gè)完全用公共數(shù)據(jù)庫資源進(jìn)行分析發(fā)文的例子來和大家分享下這方面的思路岩馍。 讀前...
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繪一棵超酷炫的系統(tǒng)發(fā)育樹！系統(tǒng)發(fā)育樹也稱為系統(tǒng)發(fā)生樹抖韩、聚類樹或者進(jìn)化樹蛀恩。它以樹狀結(jié)構(gòu)表示各個(gè)節(jié)點(diǎn)的進(jìn)化和親緣關(guān)系，枝點(diǎn)可以是物種和基因等茂浮，在系統(tǒng)發(fā)育分析双谆、基因家族和物種進(jìn)化分析中經(jīng)常會看到此類圖片壳咕。 ...
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繪制基因染色體位置圖
最近，MapGene2Chrom web v2（http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/）偶有“歇菜”顽馋，讓我們想簡單的畫畫基因的染色體位置圖都不方便谓厘。在這...
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0基礎(chǔ)看懂轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果及后續(xù)數(shù)據(jù)應(yīng)用人非生而知之者，無論是生活中還是科研中都會遇到各種陌生事物和難題寸谜，比如這種： 或者是這樣的： 此時(shí)你的心情可能是這樣的： 做科研的時(shí)候碰到了這種難題竟稳，又沒有系統(tǒng)指導(dǎo)的話，很可...
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Ensembl和NCBI基因組下載熊痴，基因序列下載查看如今大量物種參考基因組數(shù)據(jù)已被公布他爸，對于科研工作者，可以說是一筆巨大“財(cái)富”果善。那么該如何獲取這筆“財(cái)富”呢诊笤？ 本期將介紹幾個(gè)相關(guān)的數(shù)據(jù)庫，并舉例演示如何查找和下載到想要的參考...
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轉(zhuǎn)錄組文章怎么寫能發(fā)2區(qū)文章馆类？隨著測序成本的下降，轉(zhuǎn)錄組測序已經(jīng)逐步成為分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的標(biāo)配弹谁，每年有大量的數(shù)據(jù)產(chǎn)出乾巧，這也導(dǎo)致了轉(zhuǎn)錄組測序分析的文章越來越難以發(fā)表。 今天小編就給大家?guī)硪黄衲?0月份見刊...
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如何繪制漂亮的多重序列比對圖
由于軟件的功能限制预愤，一些比對軟件生成的比對文件沟于，如Clustalx的*.aln文件，可讀性差植康，無法滿足高質(zhì)量期刊的要求旷太。因此，在實(shí)際操作過程中销睁，需要對一些多重序列比對的文件進(jìn)...
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如何計(jì)算蛋白序列的長度供璧、分子量、等電點(diǎn)等信息
做基因家族等分析時(shí)冻记，有時(shí)候我們想知道蛋白質(zhì)的分子量睡毒、等電點(diǎn)信息以及序列長度等信息。今天冗栗，小編教大家如何獲取這些信息演顾。 ExPASy ProtParam在線獲取 ExPASyP...
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如何快速從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中篩選目標(biāo)基因供搀！
如何從海量高通量測序數(shù)據(jù)中篩選出目標(biāo)數(shù)據(jù)？這是困擾大多數(shù)老師的一個(gè)難題钠至！ 小編以一個(gè)excel的簡單函數(shù)為例趁曼，演示一下如何從表格中快速篩選感興趣的基因等信息。 函數(shù)的名稱是V...
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生信人的Linux練習(xí)生信人的linux考試20題 一、 在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列 這個(gè)題目考的mkdir -p的用法掰盘，詳見Linux Day...
