公眾號 生信小課堂
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Bulk RNA-Seq 差異表達分析流程以前寫過不少零散的 RNA-Seq 分析文章缰儿，現(xiàn)在整理為流程，同時修改一些錯誤乖阵。流程包含質(zhì)控宣赔、比對瞪浸、定量、差異分析对蒲。 前處理 拿到原始 fastq 數(shù)據(jù)先進行前處理钩蚊。前處理包...
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沒那么多線程
比對軟件STAR的使用
在之前的學(xué)習(xí)和練習(xí)里碑韵，比對這一步我使用過bowtie2（DNA比對）和hisat2（RNA-seq比對），現(xiàn)在學(xué)習(xí)另一個很火的軟件：STAR祝闻。STAR能夠發(fā)現(xiàn)非典型拼接和嵌合...
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宏基因組和16s的相關(guān)分析流程陨瘩、方法、所用工具
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課程會在2019年9月底之前錄制完畢并上線： 課程說明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代碼在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 觀看鏈接 手機微信觀看（推薦）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 電腦瀏覽器的鏈接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
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轉(zhuǎn)錄因子詳細介紹(motif)TF: transcription factor轉(zhuǎn)錄因子TFBS: transcription factor binding site轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點TFBS是序列內(nèi)的loc...
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samtools 工具
參考文章：https://www.cnblogs.com/xiaofeiIDO/p/6805373.html1潭辈、view主要功能：sam和bam文件之間相互轉(zhuǎn)換鸯屿，針對bam文...
