240 發(fā)簡(jiǎn)信
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  • @jijitoutou 額匆笤,tpm為啥需要標(biāo)準(zhǔn)化,tpm每個(gè)樣本的和相等,還需要再標(biāo)準(zhǔn)化一次嗎

    Read count、CPM春贸、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別

    1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到遗遵。一般而言祥诽,隨著測(cè)序深度的增加,基因種類(lèi)以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...

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    基因功能富集

    一 基礎(chǔ)知識(shí) 1厘熟、什么是富集分析屯蹦? 富集分析的原理一個(gè)生物過(guò)程通常是由一組基因共同參與,而不是由單個(gè)基因獨(dú)自完成绳姨。富集分析的基本前提假設(shè)是登澜,如果一個(gè)生物學(xué)過(guò)程在已知的研究中發(fā)...

  • 一般細(xì)胞群足夠多,并且不在細(xì)分

    clustree : 聚類(lèi)可視化利器

    我們知道在研究問(wèn)題時(shí)飘庄,分組是很重要的脑蠕,有分組才有故事可講。比如,兩塊田一塊施肥一塊不施肥,可以做比較嘛金度。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類(lèi)(clustering)...

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    clustree : 聚類(lèi)可視化利器

    我們知道在研究問(wèn)題時(shí)项郊,分組是很重要的,有分組才有故事可講劫樟。比如,兩塊田一塊施肥一塊不施肥,可以做比較嘛掀虎。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類(lèi)(clustering)...

  • 暫別簡(jiǎn)書(shū)浊竟,后會(huì)有期

    我不是老師怨喘,也不是大神,更不是前輩振定。我只是個(gè)普通的科研工作者必怜,一個(gè)只想努力變得更好的人。 來(lái)到簡(jiǎn)書(shū)快3年了后频,期間寫(xiě)了不少的筆記梳庆。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙摹V两?..

  • count normalization的方法

    count normalization的方法 這應(yīng)該會(huì)是一個(gè)小系列卑惜,我會(huì)簡(jiǎn)單介紹下現(xiàn)在的一些count normaliztion的方法膏执,以及對(duì)應(yīng)的代碼解釋、思考残揉,從而最后得出...

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    Python黑科技系列11-自動(dòng)化工具破解VIP付費(fèi)文章下載數(shù)據(jù)

    序言 不要懼怕還未到來(lái)的結(jié)果胧后,要堅(jiān)信,人生那么長(zhǎng)抱环,執(zhí)著努力的人壳快,一定會(huì)被時(shí)光溫柔以待纸巷。愿一切為之努力的事情,都有浪漫的結(jié)果眶痰。不動(dòng)聲色地變好瘤旨,每一天都要比昨天更加好。僅此一生竖伯,...

  • 哪個(gè)更好呢

    Read count足淆、CPM、 RPKM礁阁、FPKM和TPM的區(qū)別

    1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到缸浦。一般而言,隨著測(cè)序深度的增加氮兵,基因種類(lèi)以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...

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    Read count、CPM歹鱼、 RPKM泣栈、FPKM和TPM的區(qū)別

    1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到。一般而言弥姻,隨著測(cè)序深度的增加南片,基因種類(lèi)以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...

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    跟著Science Advances學(xué)畫(huà)圖:R語(yǔ)言ggplot2畫(huà)圖如何讓坐標(biāo)軸以科學(xué)計(jì)數(shù)法顯示

    今天的推文是昨天推文的延續(xù)。在昨天的推文中模仿了論文 Landscapes of bacterial and metabolic signatures and their i...

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