@jijitoutou 額匆笤,tpm為啥需要標(biāo)準(zhǔn)化,tpm每個(gè)樣本的和相等,還需要再標(biāo)準(zhǔn)化一次嗎
Read count、CPM春贸、 RPKM、FPKM和TPM的區(qū)別1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到遗遵。一般而言祥诽,隨著測(cè)序深度的增加,基因種類(lèi)以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...
一般細(xì)胞群足夠多,并且不在細(xì)分
clustree : 聚類(lèi)可視化利器我們知道在研究問(wèn)題時(shí)飘庄,分組是很重要的脑蠕,有分組才有故事可講。比如,兩塊田一塊施肥一塊不施肥,可以做比較嘛金度。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類(lèi)(clustering)...
我們知道在研究問(wèn)題時(shí)项郊,分組是很重要的,有分組才有故事可講劫樟。比如,兩塊田一塊施肥一塊不施肥,可以做比較嘛掀虎。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中用到較多的數(shù)據(jù)分組技術(shù)是聚類(lèi)(clustering)...
我不是老師怨喘,也不是大神,更不是前輩振定。我只是個(gè)普通的科研工作者必怜,一個(gè)只想努力變得更好的人。 來(lái)到簡(jiǎn)書(shū)快3年了后频,期間寫(xiě)了不少的筆記梳庆。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙摹V两?..
count normalization的方法 這應(yīng)該會(huì)是一個(gè)小系列卑惜,我會(huì)簡(jiǎn)單介紹下現(xiàn)在的一些count normaliztion的方法膏执,以及對(duì)應(yīng)的代碼解釋、思考残揉,從而最后得出...
序言 不要懼怕還未到來(lái)的結(jié)果胧后,要堅(jiān)信,人生那么長(zhǎng)抱环,執(zhí)著努力的人壳快,一定會(huì)被時(shí)光溫柔以待纸巷。愿一切為之努力的事情,都有浪漫的結(jié)果眶痰。不動(dòng)聲色地變好瘤旨,每一天都要比昨天更加好。僅此一生竖伯,...
哪個(gè)更好呢
Read count足淆、CPM、 RPKM礁阁、FPKM和TPM的區(qū)別1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到缸浦。一般而言,隨著測(cè)序深度的增加氮兵,基因種類(lèi)以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...
1. 為什么我們要進(jìn)行Normalization 測(cè)序深度:某些低表達(dá)量的基因只有在較高的測(cè)序深度時(shí)才能檢測(cè)到。一般而言弥姻,隨著測(cè)序深度的增加南片,基因種類(lèi)以及可變剪接體的數(shù)目也會(huì)...
今天的推文是昨天推文的延續(xù)。在昨天的推文中模仿了論文 Landscapes of bacterial and metabolic signatures and their i...