Jiang, Y. Z., Ma, D., Suo, C., Shi, J., Xue, M., Hu, X., ... & Shao, Z. M. (2019). Geno...
Jiang, Y. Z., Ma, D., Suo, C., Shi, J., Xue, M., Hu, X., ... & Shao, Z. M. (2019). Geno...
當(dāng)初在簡(jiǎn)書平臺(tái)更內(nèi)容一方面是出于搜索方便忍燥,另外一方面我自己在簡(jiǎn)書學(xué)到很多東西,多少想回饋一下隙姿,現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)簡(jiǎn)書也開始有亂七八糟的廣告了梅垄,而且審核太嚴(yán), 莫名其妙输玷,數(shù)據(jù)也不行队丝。今日...
大家好,好久不見饲嗽。休息了一段時(shí)間,同時(shí)去找工作去啦奈嘿!今天我們來看一篇難度不高貌虾,但是工作量不算小的文章,同時(shí)學(xué)習(xí)一下怎么提升自己孟德爾隨機(jī)化研究的level裙犹。文章:Geneti...
今天更完就休息幾天啦尽狠。GWAS數(shù)據(jù)在作為孟德爾隨機(jī)化暴露或者結(jié)局?jǐn)?shù)據(jù)時(shí),偶爾也會(huì)遇到一些坑叶圃,比如說有些數(shù)據(jù)只有染色體以及位置信息袄膏,并沒有SNP號(hào),這個(gè)時(shí)候就比較尷尬掺冠,所以我們...
PheWAS即看一個(gè)SNP對(duì)所有疾病可能的影響,也是一種非常有趣的斥黑、可以用公開數(shù)據(jù)揖盘、四兩撥千斤的研究方法,也是一種類似meta分析的方法锌奴。今天我們來看一篇用某個(gè)SNP代理基因...
大家好兽狭,所謂科研界自古以來就有一句話:遇事不決,腸道菌群鹿蜀。當(dāng)然箕慧,我可能不太懂腸道菌群或者16S測(cè)序,但多少懂點(diǎn)孟德爾隨機(jī)化茴恰,今天我們來看一篇用腸道菌群做暴露颠焦,用孟德爾隨機(jī)化做...
大家好,孟德爾隨機(jī)化很多人都是從TwoSampleMR包入手學(xué)習(xí)的琐簇,很多GWAS的概念如果不搞清楚蒸健,寫SCI的時(shí)候容易犯一些概念性的錯(cuò)誤,低分的雜志可能大家都很水婉商,可能也就一...
因?yàn)槲易约貉芯康念I(lǐng)域跨單細(xì)胞似忧、QTL、以及孟德爾隨機(jī)化丈秩,所以就一直在思考這個(gè)問題:?jiǎn)渭?xì)胞能不能和孟德爾隨機(jī)化聯(lián)合起來研究盯捌? 這方面的文章或者研究比較少。兩個(gè)組學(xué)能夠聯(lián)合我能想...
上一次我們聊了去卷積的話題蘑秽,去卷積就是把一個(gè)完整的東西解構(gòu)為n個(gè)特征饺著,如一個(gè)小狗=鼻子*1+眼睛*2+有毛等。在轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中肠牲,好像最早的去卷積就是CIBERSORT或者ssG...
有的LP就是-log10(P),有的數(shù)據(jù)直接給到P
孟德爾隨機(jī)化GWAS完整的VCF文件列名都是什么意思大家好幼衰,好久不見,這個(gè)公眾號(hào)目前只有我在寫缀雳,所有更新隨心所欲渡嚣,想起來什么就發(fā)點(diǎn)啥,也不為掙錢肥印,希望能跟大家分享一些自己在生信學(xué)習(xí)中的感受识椰。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來...
大家好腹鹉,好久不見,公眾號(hào)目前只有我一個(gè)人在寫敷硅,隨心情更新功咒。之前一直在說孟德爾隨機(jī)化的話題愉阎,今天聊聊單細(xì)胞。很多我已經(jīng)習(xí)以為常的東西可能很多人完全不懂航瞭,或者看見這一類題材就怵诫硕,...
大家好,公眾號(hào)目前只有我一個(gè)人在寫刊侯,隨心情更新≌掳欤現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來越卷了,而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn)滨彻,對(duì)我們這種臨床gou特別不友好藕届。那么有沒有不用做實(shí)...
大家好,好久不見亭饵,現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來越卷了休偶,而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn),對(duì)臨床gou特別不友好辜羊。那么有沒有不用做實(shí)驗(yàn)還可以發(fā)高分的文章呢踏兜?答案很明確,是...
現(xiàn)在純做轉(zhuǎn)錄組想發(fā)個(gè)文章已經(jīng)越來越卷了碱妆,而且好多期刊已經(jīng)明確規(guī)定了要加實(shí)驗(yàn),對(duì)臨床gou特別不友好昔驱。那么有沒有不用做實(shí)驗(yàn)還可以發(fā)高分的文章呢疹尾?答案很明確,是有的骤肛,我可以列出一...
大家好纳本,好久不見,這個(gè)公眾號(hào)目前只有我在寫腋颠,所有更新隨心所欲繁成,想起來什么就發(fā)點(diǎn)啥,也不為掙錢淑玫,希望能跟大家分享一些自己在生信學(xué)習(xí)中的感受巾腕。 上次我們把完整的vcf數(shù)據(jù)提取出來...
前面已經(jīng)簡(jiǎn)單介紹過GWAS的概念回铛,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程狗准,我們?cè)贕WAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會(huì)看到beta值和P值,他們分別代表什么意思茵肃?這兩個(gè)值又有什么關(guān)系呢...