KS科研分享與服務(wù)

CellPhoneDB作為出鏡率很高的細(xì)胞互作分析工具虱颗，也是大家公認(rèn)的。網(wǎng)上有很多教程叹哭，按理說在自己單細(xì)胞系列也應(yīng)該出一個(gè)教程喊积，但是由于CellPhoneDB是基于pytho...

Seurat_Satija

導(dǎo)讀 在腫瘤相關(guān)研究中，一張精美的生存分析圖，已經(jīng)成了腫瘤研究高分文章的標(biāo)配。好的臨床預(yù)后效果蜓洪，往往在一定程度上決定了文章發(fā)表的層次。然而對剛剛拿到一個(gè)新基因的新手來說泛鸟，生存...

王詩翔

之前分析TCGA數(shù)據(jù)都是直接匹配barcode蝠咆，其規(guī)則懂的不多。相信有不少同志也有這方面困惑北滥。 這里給出兩份資料，一份是TCGA官方英文介紹闸翅，鏈接為https://wiki....

單細(xì)胞空間交響樂

隔離的第四天再芋，一個(gè)人的日子總是很難熬，孤獨(dú)的生活卻總是來到我的身邊坚冀，這一篇我們來分享EcoTyper的示例代碼济赎，幫助我們來尋找細(xì)胞特異性轉(zhuǎn)錄狀態(tài)和共關(guān)聯(lián)模式。這篇發(fā)表于cel...

單細(xì)胞空間交響樂

隔離的第三天，一個(gè)人的日子總是很難熬司训，沒辦法构捡，孤獨(dú)總是常伴我身，今天我們分享的文獻(xiàn)在Atlas of clinically distinct cell states and ...

六六_ryx

學(xué)習(xí)目標(biāo) 學(xué)習(xí)用DiffBind流程評估兩個(gè)樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評估樣本間的關(guān)系 評估不同工具得到的差異peaks的一致性 評估差異peaks富集的工具 ATAC-...