記錄一下右遭，也許能幫到一些人 今天安裝devtools包時(shí)總是報(bào)錯(cuò)长豁，提示gert包配置錯(cuò)誤ERROR: configuration failed ...

寫在前面：本文是新手學(xué)習(xí)全記錄吮旅，僅供參考生宛，歡迎交流亿柑！ 1. rawdata 1.1 QC 1.2 數(shù)據(jù)量統(tǒng)計(jì) 調(diào)用工具：iTools使用： 2....

哈颁虐，三月是適合寫簡(jiǎn)書的月份~這只是一篇短的心得，記錄自己剛剛遇到的問題卧须，供大家參考另绩。 背景：在用DESeq2做轉(zhuǎn)錄組差異基因儒陨，有幾個(gè)關(guān)注的mar...

寫在前面：最近很糾結(jié)于測(cè)序數(shù)據(jù)的重復(fù)率，雖然是單細(xì)胞會(huì)難免有bias笋籽，但是fastqc和fastp兩款軟件計(jì)算出來的dup%簡(jiǎn)直差太大了蹦漠，琢磨了...

轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)比對(duì)，選用了hisat2车海，比對(duì)之后發(fā)現(xiàn)結(jié)果不太懂笛园，于是整理了這篇筆記與大家分享，歡迎交流侍芝。 此處是一個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)hisat2比對(duì)結(jié)果研铆，...

最近接手了一個(gè)宏基因組項(xiàng)目，做了一段時(shí)間州叠，已構(gòu)建群體的基因豐度集棵红，其間遇到的種種問題暫且不表。本以為接著就可以進(jìn)行結(jié)構(gòu)和功能注釋咧栗，忙活了半個(gè)月終...

注釋一般有以下幾種方法窄赋，但是一般經(jīng)驗(yàn)有： 1.比對(duì)時(shí)下載UCSC格式的參考基因組，后續(xù)操作障礙少2.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備要嚴(yán)格按照軟件的說明楼熄，若遇到格式正確...