簡介 cellphoneDB 是最常見的進(jìn)行細(xì)胞通訊分析的工具，但是其分析所需環(huán)境較為復(fù)雜而且容易產(chǎn)生各類報(bào)錯(cuò)。目前常用的細(xì)胞通訊分析還有CellChat鱼辙，一款使用更容易且可...
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細(xì)胞通訊(CellChat)高級(jí)配受體氣泡圖 -
【單細(xì)胞】ggplot2美化monocle2軌跡展示結(jié)果前面測試過monocle2/3禁添，但是在畫圖的時(shí)候勺疼，尤其是用默認(rèn)軟件畫圖的時(shí)候總是覺得不夠好看愉舔。比如下面這個(gè)paper中的數(shù)據(jù)（https://pubmed.ncbi.nlm....
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零基礎(chǔ)學(xué)生信入門筆記(R語言个曙、Linux炭晒、Python待逞、RNA-seq、單細(xì)胞測序腰埂、質(zhì)譜流式飒焦、TCGA、GEO屿笼、單細(xì)胞經(jīng)典文獻(xiàn)解讀)
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語言牺荠？[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)R語言[https://www...
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單細(xì)胞分群 髓系細(xì)胞的markers（持續(xù)更新）
髓系細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄markers有時(shí)候互相混雜，很難分清驴一，不同文獻(xiàn)中使用的標(biāo)記各不相同休雌。在本文中進(jìn)行記錄 單核細(xì)胞起源巨噬細(xì)胞（Monocyte-derived macropha...
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單細(xì)胞測序——糾結(jié)的髓系細(xì)胞注釋主要根據(jù)文獻(xiàn)中的描述與方法 髓系細(xì)胞分類 巨噬細(xì)胞，單核細(xì)胞肝断，DC細(xì)胞 文獻(xiàn)一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
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單細(xì)胞測序——髓系細(xì)胞注釋marker
主要根據(jù)文獻(xiàn)中的描述與方法 髓系細(xì)胞分類 巨噬細(xì)胞杈曲，單核細(xì)胞，DC細(xì)胞 文獻(xiàn)一：Single-cell landscape of the ecosystem in early...
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單細(xì)胞之軌跡分析-2：monocle2 原理解讀+實(shí)操軌跡分析系列： 單細(xì)胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.reibang.com/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析（Pseudot...
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單細(xì)胞 | Pseudobulk RNA-seq閱讀Integrated multi-omic characterization of congenital heart disease這篇文章的時(shí)候發(fā)現(xiàn)一張圖（圖2d胸懈、2e...
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01.infercnv-區(qū)分腫瘤樣本中的正常上皮細(xì)胞-infercnv運(yùn)行參考文獻(xiàn)Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequenci...
