軟件源碼安裝堪比套娃，要是在遇上python寫的程序那更“雪上加霜”了果正。。盟迟。秋泳。。攒菠。該用conda還是要用的迫皱，不要倔（sha）強(qiáng)（子），哈哈哈哈 conda在指定目錄下創(chuàng)建虛擬...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河北
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Conda設(shè)置虛擬環(huán)境
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如何給Seurat對(duì)象的基因重命名辖众？【基因名轉(zhuǎn)換】2022-07-27
適用背景 在單細(xì)胞分析中卓起，必要的一步是對(duì)每個(gè)細(xì)胞進(jìn)行注釋，這相當(dāng)于給每個(gè)細(xì)胞打個(gè)標(biāo)簽凹炸，或者說起個(gè)別名戏阅，這些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改細(xì)胞名字啤它，S...
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玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞(7)：修改Seurat對(duì)象基因名稱玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞(2):Seurat批量做圖修飾[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid=2247486164&i...
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如何優(yōu)雅的閱讀Seurat包20211109（周二）1.今天準(zhǔn)備學(xué)習(xí)scanpy單細(xì)胞分析包奕筐，走在路上想舱痘，我用seurat和scanpy的意義在哪里，多學(xué)一個(gè)軟件嗎离赫？學(xué)習(xí)軟件后面的代碼邏輯 遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于學(xué)會(huì)...
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Seurat單細(xì)胞分析常見代碼-01
1.如何通過Seurat對(duì)象獲取細(xì)胞對(duì)應(yīng)的坐標(biāo)? 2.如何通過Seurat對(duì)象獲取原始表達(dá)數(shù)據(jù)? 3.提取特定基因陽性表達(dá)的細(xì)胞芭逝？ 4.修改tsne/umap圖的配色 5.查...
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GeneOverlap: 用于基因Overlap的檢驗(yàn)及可視化R包參考學(xué)習(xí)資料：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GeneOverlap/inst/do...
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NCBI下載SRA數(shù)據(jù)的4種方法??作為生命科學(xué)的從事者，不論是老師或者學(xué)生都應(yīng)該用過NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
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生信 | 基因組組裝實(shí)戰(zhàn)（一）：基礎(chǔ)知識(shí)與基本思路寫在前面 以下內(nèi)容均來自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班課堂筆記 1. Genome de nove 基礎(chǔ)知...
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2022-11-20周末隨記
2022年11月20日 周天今天沒有想工作的任何事情渊胸，也沒開電腦旬盯，放空大腦，曬太陽翎猛，看閑書胖翰。初冬暖陽，如沐慈悲办成。我在想卷的這個(gè)事情泡态，大家都在知識(shí)或者價(jià)值的隊(duì)伍中排隊(duì)，或者說迂卢，...
