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發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：甘肅
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【單細(xì)胞】SingleR注釋細(xì)胞類型
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技術(shù) | 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序之Smart-seq2Smart-seq2 Smart-seq是由路德維格癌癥研究所的 Rickard Sandberg實(shí)驗(yàn)室[http://sandberg.cmb.ki.se/]所開(kāi)發(fā)的一套在...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析||Seurat3.1教程:Interoperability between single-cell object formats本節(jié)擅编，我們演示了在Seurat對(duì)象咳胃、singlecellexper對(duì)象和anndata對(duì)象之間進(jìn)行轉(zhuǎn)換的能力渗稍。以建立Seurat與其他單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析工具之間的鏈接纵东。 Seur...
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scanpy分析單細(xì)胞數(shù)據(jù)R在讀取和處理數(shù)據(jù)的過(guò)程中會(huì)將所有的變量和占用都儲(chǔ)存在RAM當(dāng)中抹锄，這樣一來(lái)藻雌，對(duì)于海量的單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)（尤其是超過(guò)250k的細(xì)胞量）孽拷，即使在服務(wù)器當(dāng)中運(yùn)行吨掌，Seura...
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可以用awk將剩下三列信息手動(dòng)添加上去，第四列是基因名字脓恕，可以自己先任意命名膜宋，或者參照基因組注釋。第五列就用“.”代替就行炼幔。第六列表示正負(fù)鏈信息秋茫，不重要的話就都標(biāo)成“+”吧。參照命令：awk -v OFS="\t" '{print $1, $2, $3, "Gene", ".", "+" }' your.col3.bed > new.col6.bed
【生信】格式轉(zhuǎn)換：轉(zhuǎn)成bed及bed12格式
基因組注釋gtf文件或bed6文件轉(zhuǎn)bed12文件 上一篇詳細(xì)介紹了bed格式乃秀，尤其清楚的解釋了bed格式中的最后三列肛著，這三列對(duì)于理解bed12格式轉(zhuǎn)換至關(guān)重要。 本文主要介...
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教你用科學(xué)雜志喜歡的配色作圖——R包ggsci
ggsci是ggplot的主題包跺讯，它提供一系列高質(zhì)量的調(diào)色板枢贿，其靈感來(lái)自于科學(xué)期刊、數(shù)據(jù)可視化庫(kù)刀脏、科幻電影和電視節(jié)目中使用的顏色局荚。ggsci中的調(diào)色板可以作為ggplot2s...
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2019-06-09
R的安裝還是很簡(jiǎn)單的，在cran上找到下載連接,然后下載安裝包就好了。同樣耀态，安裝后續(xù)的Rstudio也是如此轮傍。將兩個(gè)軟件都安裝好后，試著在Rstudio里安裝第三方的Libr...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.reibang.com/p...
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Linux下的并行神器——parallel
GNU Parallel是一個(gè)shell工具茫陆，為了在一臺(tái)或多臺(tái)計(jì)算機(jī)上并行的執(zhí)行計(jì)算任務(wù)金麸。本文簡(jiǎn)要介紹GNU Parallel的使用。 1簿盅、parallel 用法簡(jiǎn)介 1.1...
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為PPT添加進(jìn)度條
PPT頁(yè)數(shù)多的時(shí)候挥下，總等不到演講者結(jié)束。自己反過(guò)來(lái)想桨醋，我的PPT必須每次添加進(jìn)度條棚瘟，讓聽(tīng)的人心里有個(gè)數(shù)，到底ta還要忍受多少頁(yè)P(yáng)PT才能離開(kāi)喜最。自己新建了一個(gè)PPT模板偎蘸，添加了...
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VBA 要點(diǎn)碎碎念
1. 如果你想從一個(gè)表中復(fù)制到另外一個(gè)工作簿，當(dāng)前工作簿必須處于激活狀態(tài)瞬内，否則直接報(bào)錯(cuò)迷雪。 2. VBA 寫(xiě)入含有公式的單元格會(huì)觸發(fā)工作表重算，怎么避免觸發(fā)工作表重算虫蝶？ ' E...
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PPT VBA 的學(xué)習(xí)筆記
PPT VBA 與 Excel VBA 的對(duì)比 掌握 VBA 并不是一門業(yè)余愛(ài)好章咧，而是一種工作能力，才成為職業(yè)安全的保障能真。同時(shí)赁严，現(xiàn)代企業(yè)業(yè)務(wù)對(duì) VBA 的解決方案需求巨大， ...
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endnote 第100行縮進(jìn)變寬解決辦法檢查畢業(yè)論文時(shí)粉铐，發(fā)現(xiàn)一個(gè)問(wèn)題疼约，endnote加入的參考文獻(xiàn)：第100個(gè)參考文獻(xiàn)，編號(hào)和參引文字之間距離變寬蝙泼，如下： 百度了一下程剥，沒(méi)有找個(gè)合適的方法，于是自己研究了一下Endn...
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雙色球開(kāi)獎(jiǎng)號(hào)碼
文檔整理了中國(guó)福彩雙色球汤踏，從第一期（20130101）到20190516倡缠，所有開(kāi)獎(jiǎng)號(hào)碼，中獎(jiǎng)人數(shù)茎活、中獎(jiǎng)金額和銷售額等信息昙沦，Excel表格免費(fèi)下載。 *：本列表利用python...
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福彩3D開(kāi)獎(jiǎng)號(hào)碼
文檔整理了福彩3D载荔，從第一期（20041018）到20190516盾饮，所有開(kāi)獎(jiǎng)號(hào)碼，中獎(jiǎng)注數(shù)和返獎(jiǎng)率信息，Excel表格免費(fèi)下載丘损。 *：本列表利用python爬蟲(chóng)腳本獲得普办，后續(xù)...
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R使用筆記: ggplot2做boxplot的幾個(gè)細(xì)節(jié)本次筆記內(nèi)容：fill =的位置： ggplot(aes(fill = )) & geom_boxplot(fill = ) & geom_boxplot(aes(fill ...
