寫(xiě)在前面 我受夠了跷敬!整天有人問(wèn)讯私,TBtools怎么畫(huà)這個(gè)圖 但是我其實(shí)只想回一句: 你畫(huà)這個(gè)圖干什么?有什么意義?你想說(shuō)談什么生物學(xué)故事斤寇? 承認(rèn)吧桶癣,你什么都不知道,什么都沒(méi)搞...
本文參考 生信札記[http://www.reibang.com/u/068665394ccf] 相關(guān)內(nèi)容制作 準(zhǔn)備數(shù)據(jù): 1.物種內(nèi)的共線性分析 2.已經(jīng)鑒定好的基因家族...
寫(xiě)在前面 在很久很久以前,由于課題的需要馏锡,我寫(xiě)了一個(gè)Circos圖繪制功能(在TBtools里《任何人雷蹂!十分鐘掌握Circos圖繪制》)....從那以后,我就再也沒(méi)用過(guò)杯道。這是...
一:準(zhǔn)備文件 1.染色體長(zhǎng)度文件 偷懶直接打開(kāi)gff文件党巾,前幾行就是染色體信息萎庭,粘貼出來(lái)就好,保存為chr_length.txt 2.Text文件 在圖片中顯示的gene名字...
更多內(nèi)容關(guān)注微信公眾號(hào):“今日之森” 后獲取。 “好看的皮囊千篇一律署海,有趣的靈魂萬(wàn)里挑一” 進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建絕不僅僅是將一堆序列扔進(jìn)MEGA等建樹(shù)軟件吗购,隨便生成樹(shù)那么簡(jiǎn)單,因?yàn)榭?..
寫(xiě)在前面 半個(gè)月前砸狞,我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程(原本事實(shí)是開(kāi)給課題組)捻勉。在熱身課程(完全免費(fèi))中,將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明刀森,感...
寫(xiě)在前面 年初在汕頭婚宴上研底,我問(wèn)一個(gè)朋友埠偿,現(xiàn)在在做什么工作。他回復(fù)了我: 但行好事榜晦,莫問(wèn)前程冠蒋。 現(xiàn)在看來(lái),挺好乾胶。 構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的基礎(chǔ)是序列對(duì)齊浊服,或者說(shuō)多序列比對(duì)统屈。做序列對(duì)齊的主...
報(bào)錯(cuò)原因:輸入的alignment軟件中有序列間沒(méi)有等位位點(diǎn),導(dǎo)致遺傳距離有缺失值,無(wú)法計(jì)算遺傳距離腕扶。 解決辦法:刪除相互之間沒(méi)有共同等位位點(diǎn)的序列孽拷,重新導(dǎo)入mega中即可。
前面推文所提基本性質(zhì)的分析(理化性質(zhì),基因染色體分布史简,基因結(jié)構(gòu)乃秀、基序和保守結(jié)構(gòu)域)已完成,進(jìn)一步基因家族成員的進(jìn)化分析可以推測(cè)未知基因的功能圆兵,也會(huì)讓文章更為完整跺讯。進(jìn)化分析包括...
小編今天給大家介紹一款在線繪制基因結(jié)構(gòu)的工具Gene Structure Dispaly Server,簡(jiǎn)單好用功能還挺強(qiáng)大殉农。運(yùn)用它能夠繪制清晰的基因結(jié)構(gòu)刀脏,清晰明了地展示外顯...