240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    irGSEA:基于秩次的單細(xì)胞基因集富集分析整合框架(修訂版)

    一光酣、背景 許多Functional Class Scoring (FCS)方法疏遏,如GSEA, GSVA,PLAGE, addModuleScore, SCSE, Vision...

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    TCGA 數(shù)據(jù)下載分析利器 —— TCGAbiolinks(一)

    前言 TCGAbiolinks 是一個(gè)利用 GDC API 接口來查詢、下載和分析 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)的 R 包 TCGAbiolinks 包的功能主要可以分為三大塊: ...

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    【R>>PCA】主成分分析

    PCA:principal component analysis,主成分分析夺姑。將n個(gè)維度墩邀,通過線性轉(zhuǎn)換為新的n個(gè)線性無關(guān)的按方差解釋度排序的主成分(principal com...

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    【R>>e1071】tune.svm亞型預(yù)測(cè)

    疾病亞型預(yù)測(cè)中常用NTP方法,今天發(fā)現(xiàn)一位大神用svm預(yù)測(cè)亞型盏浙,并且在附件中還加入了代碼眉睹,下面就來圍觀下吧荔茬。 發(fā)表雜志:Frontiers in Oncology PMID:...

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    免疫治療結(jié)果與風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)的直方圖

    1.需求 為了直觀的展示免疫治療結(jié)果與病人風(fēng)險(xiǎn)高低之間的關(guān)系侣诵,如圖: 2.數(shù)據(jù) 需要病人的高低風(fēng)險(xiǎn)分組痢法,和免疫治療結(jié)果 3.畫圖代碼 因?yàn)閿?shù)據(jù)是編的,就不用看high和low...

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