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Seurat是單細(xì)胞分析經(jīng)常使用的分析包。seurat對(duì)象的處理是分析的一個(gè)難點(diǎn)课锌,這里我根據(jù)我自己的理解整理了下常用的seurat對(duì)象處理的一些操作厨内,有不足或者錯(cuò)誤的地方希望...
R語言中創(chuàng)建函數(shù)參數(shù)的問題 R可以很方便的指定任意長度的參數(shù)列表(…)可以表示將額外的參數(shù)傳遞給另外的一個(gè)函數(shù) - 再有就是可以表示參數(shù)可變 舉例說明 該計(jì)算會(huì)將 … 額外的...
哇 探究的過程好厲害v佟!送爸!一步步研究下去發(fā)現(xiàn)問題铛嘱,解決問題,思路清晰袭厂,牛皮墨吓!
GEO數(shù)據(jù)分析中exprs提取表達(dá)矩陣,pData提取臨床信息關(guān)于用getGEO下載數(shù)據(jù)后纹磺,會(huì)得到一個(gè)list帖烘,取出第一個(gè)列表中的元素后,再查看這第一個(gè)元素的數(shù)據(jù)類型后橄杨,發(fā)現(xiàn)他是一個(gè)對(duì)象("ExpressionSet")秘症,然后我們就會(huì)用...
一.第一代測(cè)序 必備概念:ddNTP 雙脫氧的核苷酸乡摹,可以被DNA聚合酶識(shí)別結(jié)合到DNA鏈上,但由于沒有本來要用來和下一個(gè)核苷酸形成磷酸二酯鍵的氧采转,所以在它后面DNA鏈終...
安裝R包步驟 1- 先配置下載鏡像 三種方法:1)在Rstudio手動(dòng)設(shè)置聪廉,但是這個(gè)是CRAN的鏡像,如果要下載Bioconductor的包故慈,這個(gè)鏡像是沒有辦法用的板熊。 為了保...
R包學(xué)習(xí) 安裝加載 鏡像設(shè)置 通過options()BioC_mirror檢驗(yàn)Bioconductor的鏡像 自定義CRAN和Bioconductor的下載鏡像:option...
一.配置R的鏡像 Bioconductor的鏡像查詢 1.切換鏡像 tools-packages-change 切換的是CRAN的鏡像M惭稀!情萤!下載Bioconductor時(shí)無...