montreal生信人2018-02-07 大家好影涉！又見面了郁轻。本期承接上期進(jìn)化樹作圖專題1的內(nèi)容，和大家分享一下關(guān)于進(jìn)化樹圖的幾種分類禀倔。 依據(jù)不同規(guī)則，樹的分類可以有很多種椿猎。...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河北
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進(jìn)化樹作圖專題2：進(jìn)化樹的幾種分類
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研究生在讀簿晓，植物病原真菌致病基因功能解析&生信分析~歡迎相互交流，共同進(jìn)步千埃。
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構(gòu)建某一基因家族的進(jìn)化樹
寫在前面繪制某一基因家族的進(jìn)化樹憔儿，這是基因組學(xué)研究過程中不可缺少的一部分。劃分成不同的基因家族的依據(jù)一般是其具有某一相同的結(jié)構(gòu)域放可，下面我將以水稻中GUB_WAK_bind類家...
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中科院碩博生一枚耀里，用簡(jiǎn)書來記錄自己精讀paper和學(xué)習(xí)生信的過程蜈缤。
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基于全基因組的基因家族分析（4）：R包ggtree構(gòu)建SlNramp家族進(jìn)化樹繼續(xù)之前還沒有完成的內(nèi)容。因?yàn)樽罱趯W(xué)習(xí)Y叔的R包--ggtree冯挎，所以就順便拿這個(gè)內(nèi)容來進(jìn)行展示劫樟，作為一個(gè)例子來記錄。nwk樹文件和R代碼文件我已經(jīng)放在github：htt...
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基因家族分析（3）進(jìn)化樹構(gòu)建及美化基因家族樹構(gòu)建最常用的方法是 NJ 法和 ML 方法织堂，構(gòu)建進(jìn)化樹之前叠艳，需要進(jìn)行多序列比對(duì)。 多序列比對(duì) 多序列比對(duì)的作用是將核酸或者氨基酸序列對(duì)齊易阳，使得相同殘基的位點(diǎn)位于同一...
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進(jìn)化樹構(gòu)建背景資料一附较、背景資料 進(jìn)化樹（evolutionary tree）又名系統(tǒng)樹（phylogenetie tree）進(jìn)化樹，用來表示物種間親緣關(guān)系遠(yuǎn)近的樹狀結(jié)構(gòu)圖潦俺。在進(jìn)化樹中拒课，各個(gè)分類...
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CFVisual繪制Motif+基因結(jié)構(gòu)+結(jié)構(gòu)域+進(jìn)化樹+啟動(dòng)子圖的單獨(dú)或組合圖1. 軟件簡(jiǎn)介 CFVisual_V2.1軟件是一款借助Python語言的matplotlib庫(kù)和PySide2庫(kù)進(jìn)行生物序列結(jié)構(gòu)繪圖的數(shù)據(jù)可視化軟件早像，主要用于生物信...
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基因家族數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)站更新：pfam to InterPro在基因家族分析中，通過pfam數(shù)據(jù)庫(kù)檢索獲得已知基因家族的hmm模型(隱馬模型)是必不可少的一步肖爵，最近發(fā)現(xiàn)pfam數(shù)據(jù)庫(kù)有變動(dòng)卢鹦，和大家分享一下。 1. pfam數(shù)據(jù)庫(kù) pfa...
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微信公眾號(hào)：bioinformatic
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微信公眾號(hào)：ITBioMagicBoy
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上海嘉因生物科技有限公司含末，表觀遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)領(lǐng)跑者延塑，上海市高新技術(shù)企業(yè)，博士后流動(dòng)站答渔」卮科研服務(wù)領(lǐng)域主要產(chǎn)品線：CUT&Tag/ChIP-seq，ATAC-seq沼撕，1微克MeRIP-seq宋雏， eccDNA-seq（環(huán)狀DNA測(cè)序），單細(xì)胞ATAC-seq和單細(xì)胞RNA-seq务豺。在臨床檢測(cè)領(lǐng)域磨总，團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一整套針對(duì)cfDNA甲基化的實(shí)驗(yàn)檢測(cè)技術(shù)和數(shù)據(jù)分析技術(shù)，相關(guān)應(yīng)用產(chǎn)品正在臨床實(shí)驗(yàn)階段笼沥。
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生物信息奔浅；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~<br>生信博士在讀~ wx同號(hào)～
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生信技能樹钥弯，生信菜鳥團(tuán)，jimmy
