中山大學中山醫(yī)學院-基礎醫(yī)學博士在讀<br>歡迎關注個人公眾號<br><br>公眾號：bioinfomics<br>博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fdongwei1220.github.io%2F" target="_blank">https://dongwei1220.github.io/</a><br>
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AgRenSeq一種不依賴參考基因組且能快速克隆R基因的GWAS方法個人總結：GWAS是復雜性狀相關基因定位的常用手段鸥滨，其結果與參考基因組的選擇有關项玛，若多樣性群體中的候選基因不存在于參考基因組腻脏，則無法鑒定范抓。而Kmer-based GWAS則不...
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單倍型分析一液荸、什么是單倍型？ 在單倍型分析前琉苇，首先需要明白什么是單倍型嘲玫、什么是基因單倍型？ 一般來講并扇，所謂的單倍型是指同一染色體上不同變異位點的各種線性組合形式去团。那么基因單倍型自然就是...
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你好我想問下AGPv2的數據是在哪里下載的？
如何使用snpEff創(chuàng)建本地數據庫
snpEff的使用是在Linux系統(tǒng)中Java運行環(huán)境下穷蛹。 一土陪、下載snpEff 方法一： 直接在家目錄下載使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
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BSA-Seq本文內容主要來自徐云碧老師2016年發(fā)表在PBJ上的綜述“Bulked sample analysis in genetics, genomics and crop impr...
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CAU 徐明良教授 玉米抗病分子育種相關工作本文內容來自徐明良教授報告，僅供學習肴熏。 玉米基因組蘊含豐富抗病基因 與禾谷類其它作物鬼雀，如水稻、小麥等不同蛙吏，玉米是典型異花授粉作物源哩，遺傳基礎復雜，基因組多樣性明顯出刷，在長期進化過...
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Linux安裝R包ggalt遇見的proj4報錯
近來在利用R包ggalt以美化pca和pcoa圖的展示璧疗，在linux環(huán)境下安裝ggalt時艺晴，遇見proj4的報錯信息如下： configure: error: libproj...
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一個標題行??
GEO數據挖掘之第一步：數據預處理與差異分析
作為一個剛接觸生物信息這個專業(yè)小白那先，我正在努力學習著最基礎的東西坷檩，最先是了解GEO數據庫却音，自己利用數據進行分析，還好之前有R語言基礎矢炼，這第一步就花了很長時間系瓢，但是完成后是很有...
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請問我下載的series_matrix文件最后導入轉換只有第一行，數據導入有什么方法嗎句灌？謝謝
GEO數據挖掘之第一步：數據預處理與差異分析
作為一個剛接觸生物信息這個專業(yè)小白夷陋，我正在努力學習著最基礎的東西，最先是了解GEO數據庫胰锌，自己利用數據進行分析骗绕，還好之前有R語言基礎，這第一步就花了很長時間资昧，但是完成后是很有...
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學習記錄1：同線性(Synteny)和共線性(Collinearity)文章僅是記錄自己的學習使用酬土，有錯誤請指出，我立刻改正格带！ 更多參考：https://shengxin.ren/question/541[https://shengxin.ren...
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啟動子研究方法高質量總結原文鏈接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/401460339 (伯遠生物) 01 啟動子的基本類型 啟動子是基因的重要組成部分撤缴，其主要功能為調控基...
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啟動子作用功能以及分類介紹
啟動子（promoter） 作用和功能：啟動子是指一段能使特定基因進行轉錄的DNA序列刹枉。啟動子可以被RNA聚合酶辨認，并開始轉錄合成RNA屈呕。在RNA合成中微宝，啟動子可以和調控基...
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答讀者問(8)：如何批量查詢marker基因(對應的蛋白)會不會在膜上表達？做實驗的朋友們對這個問題應該是很感興趣的凉袱，因為涉及到后續(xù)能不能實驗驗證芥吟。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文獻，查網站专甩。我知道的：uniprot钟鸵、PDB、the human...
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全基因組關聯(lián)分析學習資料（GWAS tutorial）20210313更新版
時隔一年多涤躲，于今日（20210313）再次更新教程棺耍，后續(xù)如果新出教程的話會一直更新。 同時感謝多年陪伴我成長种樱、一直默默關注我的「你們」~ by 「橙子牛奶糖（陳文燕）」 1....
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Fine mapping定位QTL作物遺傳育種需要發(fā)掘對農藝性狀有重要貢獻的QTL蒙袍。某一重要農藝性狀往往是由多個QTL調控。對這些QTL進行精細定位找出對應的基因對作物的改良具有重要意義嫩挤。本文對如何進行...
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作圖群體及作圖方法作圖群體 在學習數量遺傳學課程時害幅，經常碰到諸如DH群體等名詞，還是需要把相關的專業(yè)名詞積累一下岂昭。作圖群體概念及分類介紹 - 簡書 (jianshu.com)[https:...
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作圖群體概念及分類介紹這是很多年前做的關于作圖群體的PPT以现，懶得再排版了，直接截圖上傳了约啊，需要PPT的可以私信小編邑遏。在介紹作圖群體前我們先看一下之類性狀和數量性狀的差別： 當然還要知道幾個基本的概...
