我沒有看到過Seurat對細(xì)胞數(shù)的要求待错，Seurat是可以處理smart-seq2的數(shù)據(jù)的哥桥。建議試試分析看下結(jié)果绢记。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序分析--初探Seurat單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序--閑言碎語 時代發(fā)展的步伐總是毫不留情的將你甩在身后懊昨，連車尾燈都看不見躯肌。當(dāng)你還在沉迷于普通轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘時堵未，已經(jīng)有人悄悄的搞上單細(xì)胞了卷要。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序，顧...
一帆离、真核生物mRNA的結(jié)構(gòu)： 二蔬蕊、建庫方式：真核生物mRNA含有poly-A尾，因此最常用的富集真核生物mRNA的方法就是采用附著poly-T oligo的磁珠從total ...
什么是DNA甲基化盯质？DNA methylation：指在DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶的作用下袁串，在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共價鍵結(jié)合一個甲基基團(tuán)概而。為DNA化學(xué)修飾的一種形式呼巷，...
什么是16S rRNA？16S rRNA是原核生物的核糖體中30S亞基的組成部分赎瑰，長度約為1542nt王悍，具有高度的保守性和特異性。16S rRNA基因是細(xì)菌上編碼rRNA相對...
ATAC-seq：利用轉(zhuǎn)座酶研究染色質(zhì)可進(jìn)入性的高通量測序技術(shù)染色體/質(zhì)結(jié)構(gòu)：細(xì)胞核DNA與組蛋白相結(jié)合餐曼，DNA纏繞在組蛋白上形成串珠式結(jié)構(gòu)压储，因此染色質(zhì)結(jié)構(gòu)高度折疊（壓縮）鲜漩。...
T細(xì)胞受體是T細(xì)胞識別靶細(xì)胞表面特異性抗原的蛋白分子，由α鏈和β鏈（分別由TRA和TRB編碼）或者γ鏈和δ 鏈（分別由TRG和TRD編碼）構(gòu)成的異二聚體集惋，主要是以α鏈和β鏈構(gòu)...
請問你說的細(xì)胞來源分類指的是什么孕似？tsne圖呈現(xiàn)的是細(xì)胞在二維空間的分布圖，相鄰的細(xì)胞基因表達(dá)模式相似刮刑，可以很好的查看聚類結(jié)果是否正常喉祭。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序分析--初探Seurat單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序--閑言碎語 時代發(fā)展的步伐總是毫不留情的將你甩在身后，連車尾燈都看不見雷绢。當(dāng)你還在沉迷于普通轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘時泛烙，已經(jīng)有人悄悄的搞上單細(xì)胞了。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序翘紊，顧...
我代碼貼錯了蔽氨，已經(jīng)改過來了，謝謝提醒
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序分析--再說Seurat上期我們講了使用Seurat分析單個樣本帆疟，那么2個或多個樣本的分析會有哪些不同呢鹉究？單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中一個重要的問題就在于批次效應(yīng)，任何一個試驗步驟都容易帶來批次效應(yīng)踪宠，多個樣本...
上期我們講了使用Seurat分析單個樣本坊饶，那么2個或多個樣本的分析會有哪些不同呢？單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中一個重要的問題就在于批次效應(yīng)殴蓬，任何一個試驗步驟都容易帶來批次效應(yīng)匿级，多個樣本...
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序--閑言碎語 時代發(fā)展的步伐總是毫不留情的將你甩在身后，連車尾燈都看不見染厅。當(dāng)你還在沉迷于普通轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘時痘绎，已經(jīng)有人悄悄的搞上單細(xì)胞了。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序肖粮，顧...
