240 發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地:江蘇
  • 120
    使用pfam-scan進(jìn)行預(yù)測(cè)

    一屠尊、 安裝 使用conda安裝Pfam_scan pfam_scan依賴bioperl毅臊,因此,通過conda安裝簡(jiǎn)單快捷. 安裝hmmer3 , 使用以下命令安裝: 數(shù)據(jù)庫(kù)下...

  • 120
    lncRNAs——你必須了解點(diǎn)的知識(shí)

    LncRNAs的識(shí)別 lncRNA被定義為長(zhǎng)度超過200個(gè)核苷酸的非編碼RNA分子吩翻,最初是由Okazaki等人在2002年對(duì)小鼠全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的大規(guī)模測(cè)序研究中重點(diǎn)描述的胶哲。...

  • 120
    2023-03-04

    LncPheDB: a genome-wide lncRNAs regulated phenotypes database in plants 個(gè)人總結(jié): 目前植物中l(wèi)ncr...

  • Amorphea:無定形生物(Amorphea)是一個(gè)由一些真核生物組成的分類群症歇,其中包括動(dòng)物魏铅、真菌和一些原生生物,如滑鞭毛蟲和變形蟲等糟需。這些生物之間的聯(lián)系在分子水平上已經(jīng)得到了確認(rèn)屉佳。

    Archaeplastida:原始植物(Archaeplastida)是一類真核生物谷朝,包括植物、綠色藻類和紅藻武花。這些生物共同具有葉綠素a和b圆凰、卡諾酸和細(xì)胞壁中的纖維素。

    Cryptophyceae:隱藻目(Cryptophyceae)是一類真核生物体箕,它們具有類似植物的葉綠體和藻類的核糖體专钉,但其細(xì)胞壁由纖維素和多糖構(gòu)成。

    Discoba:圓盤蟲亞門(Discoba)是一類原生生物累铅,包括兩類線蟲:螺旋體和鞭毛蟲跃须,以及一個(gè)單細(xì)胞生物類群:吞噬者。

    Excavata:Excavata是一類原生生物娃兽,其中許多成員具有線粒體菇民,但其線粒體的形態(tài)和功能與其他真核生物不同。該類群包括許多寄生生物和真核生物中唯一能夠進(jìn)行磷酸化呼吸的線蟲换薄。

    Haptophyta:鉤藻門(Haptophyta)是一類真核生物玉雾,具有特殊的鞭毛和鉤狀突起,同時(shí)還具有可以形成有機(jī)碳酸鹽的質(zhì)體轻要。

    Incertae:不確定分類(Incertae sedis)指的是一些生物的分類地位未能明確確定,或者尚未被歸入已知的分類群之中垦缅。

    Picozoa:皮孔蟲(Picozoa)是一類單細(xì)胞生物冲泥,其細(xì)胞大小通常在1-5微米之間,是海洋中的一類原生生物壁涎。

    SAR:SAR超群是一個(gè)由三類真核生物組成的分類群凡恍,其中包括硅藻、裸藻怔球、藍(lán)藻嚼酝、鐮刀藻和變形蟲等生物,其名稱源于其中三類生物的英文名稱的首字母縮寫竟坛。

    整理植物rRNA序列庫(kù)

    在剛接觸生信的時(shí)候闽巩,測(cè)到的第一套數(shù)據(jù)就發(fā)現(xiàn)有一定量的rRNA,那會(huì)就找了silva數(shù)據(jù)庫(kù)担汤,經(jīng)過查看文檔涎跨,可以通過以下命令整理,得到泛植物的rRNA序列庫(kù)崭歧∮绾埽可用于去除rRNA污...

  • 整理植物rRNA序列庫(kù)

    在剛接觸生信的時(shí)候,測(cè)到的第一套數(shù)據(jù)就發(fā)現(xiàn)有一定量的rRNA率碾,那會(huì)就找了silva數(shù)據(jù)庫(kù)叔营,經(jīng)過查看文檔屋彪,可以通過以下命令整理,得到泛植物的rRNA序列庫(kù)绒尊⌒蠡樱可用于去除rRNA污...

  • 分享一個(gè)qRT-PCR引物設(shè)計(jì)軟件【Beacon Designer 8.14】

    一、軟件安裝 按照?qǐng)D中的操作垒酬,解壓安裝即可砰嘁。注意要將patch中的文件復(fù)制到Beacon Designer的安裝路徑下才可以,否則這款軟件是付費(fèi)的勘究“妫【這里上傳圖片失敗,具體可...

  • R腳本一鍵批量計(jì)算qRT-PCR和繪圖

    之前介紹了qRT-PCR引物設(shè)計(jì)方法【分享一個(gè)qRT-PCR引物設(shè)計(jì)軟件【Beacon Designer 8.14】】軟件口糕,[http://mp.weixin.qq.com/...

  • 120
    基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控

    原核生物與真核生物基因表達(dá)方式的主要區(qū)別 原核生物:基因的轉(zhuǎn)錄與mRNA的翻譯偶聯(lián)缅阳,轉(zhuǎn)錄與翻譯同步進(jìn)行,不存在mRNA的加工問題景描; 真核生物:轉(zhuǎn)錄與翻譯在空間上是隔離的十办,轉(zhuǎn)錄...

  • 120
    【文獻(xiàn)分享】植物RLCK參與各種生物過程的綜述

    寫在前面 這次分享的是遺傳所周檢民老師在2018年應(yīng)邀在《Annual Review of Plant Biology》發(fā)表的有關(guān)植物RLCK在參與植物各種生物過程的綜述"R...

  • 120
    【文獻(xiàn)分享】探索作物中的廣譜抗病性

    這次分享的文章是近期由,中科院何祖華研究員和美國(guó)俄亥俄州立大學(xué)/中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所王國(guó)梁教授受邀在Annual Review of Plant Biology撰寫題...

  • DESeq2的多組比較

    DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org/p/357464/]說來也神...

  • 120
    解決 Stringtie 基因重復(fù)定量的意外收獲

    說明:因?yàn)槠脚_(tái)限制和平臺(tái)廣告等原因超棺,今后的文章將不在簡(jiǎn)書更新向族,請(qǐng)移步并訂閱個(gè)人博客 說明:因?yàn)槠脚_(tái)限制和平臺(tái)廣告等原因,今后的文章將不在簡(jiǎn)書更新棠绘,請(qǐng)移步并訂閱個(gè)人博客 說明:...

  • 120
    用clusterProfiler進(jìn)行GSEA分析

    ****今天來關(guān)注如何使用clusterProfiler系列包來分析GSEA** 導(dǎo)入包件相,導(dǎo)入數(shù)據(jù) 今天比昨天多導(dǎo)入了一個(gè)ReactomePA包,這個(gè)包也是Y叔開發(fā)用來分析R...

  • 120
    emapplot-原來能用的函數(shù)氧苍,現(xiàn)在報(bào)錯(cuò)了腫么辦

    emapplot是富集分析可視化的一種夜矗,展示有共同基因的通路,詳見:http://www.reibang.com/p/c45cc2e3890f[https://www.ji...

  • 120
    使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析

    clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包让虐,看過了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無法自拔紊撕。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔,加上了我的測(cè)試數(shù)據(jù)(還是以果蠅為例)赡突。 一对扶、...

  • @研究僧小藍(lán)哥 感謝

    非模式生物基因GO富集分析:以水稻為例

    模式生物做什么都簡(jiǎn)單,非模式生物則很多缺少注釋麸俘,沒有注釋你就沒法做辩稽,只能是借助于各種軟件比如blastgo,自己跑電子注釋从媚。但今天要講的不是這種情況逞泄,很多物種還是有注釋的,只...

  • 寫一個(gè)自動(dòng)轉(zhuǎn)換不同數(shù)據(jù)庫(kù)間水稻基因ID和名稱的Python程序

    原因還是一樣,為了提高課題組科研效率這次就懶得放代碼了程序效果如下: 已生成可運(yùn)行的單個(gè)exe文件喷众,請(qǐng)有需要的同學(xué)自行下載各谚。如有轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。鏈接:https://pan....

  • 120
    一文解決找不到電腦文件的煩惱

    Everything 相信大家在累積了幾年的科研數(shù)據(jù)以后到千,總會(huì)因?yàn)轫樖謱⑽募4嬖陔娔X里昌渤,但是回頭找的時(shí)侯,因?yàn)闀r(shí)間過去太久了憔四,而找不到膀息,給本就艱難的科研雪上加霜,十分的煩躁...

個(gè)人介紹
個(gè)人wx公眾號(hào) 生信森林
亚洲A日韩AV无卡,小受高潮白浆痉挛av免费观看,成人AV无码久久久久不卡网站,国产AV日韩精品