240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    NGS012 轉(zhuǎn)座酶建庫(kù)及ATAC-seq

    轉(zhuǎn)座因子 Transposon 一段DNA順序可以從原位上單獨(dú)復(fù)制或斷裂下來(lái)摇庙,環(huán)化后插入另一位點(diǎn),并對(duì)其后的基因起調(diào)控作用遥缕,此過(guò)程稱轉(zhuǎn)座卫袒。這段序列稱跳躍基因或轉(zhuǎn)座子。轉(zhuǎn)座子是...

  • PyMOL學(xué)習(xí)筆記

    PyMOL是一款生物大分子三維結(jié)構(gòu)顯示軟件,其中“Py”是指此軟件使用Python語(yǔ)言編寫户秤,“MOL”是指Molecule码秉。 PyMOL官網(wǎng)是http://www.PyMOL...

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    蛋白質(zhì)經(jīng)泛素-蛋白酶體降解研究基本思路(圖文詳解)

    泛素和泛素化介紹 泛素 泛素為含76個(gè)氨基酸莉兰、大小約為8.6 kDa的小蛋白質(zhì)挑围,在真核生物中普遍存在且高度保守。人類基因組中的四個(gè)基因編碼泛素:UBB糖荒,UBC杉辙,UBA52和R...

  • @凍春卷 也謝謝你的系列推文(●'?'●)

    CRISPR-Cas9基因編輯7--測(cè)序驗(yàn)證敲除

    前言: 使用挑單克隆技術(shù)得到多個(gè)單克隆細(xì)胞系后,就要開(kāi)始驗(yàn)證敲除捶朵,除了蛋白表達(dá)水平的檢測(cè)蜘矢,最終還是要看測(cè)序結(jié)果。關(guān)于測(cè)序的方案也是各有不同综看,由于之前選用的是CRISPR-Ca...

  • @凍春卷 從去年年底看你的推文開(kāi)始學(xué)習(xí)品腹,現(xiàn)在終于拿到KO細(xì)胞系了,非常感謝你這個(gè)系列推文對(duì)我的幫助红碑!
    分享下我個(gè)人挑單克隆過(guò)程:96孔板內(nèi)轉(zhuǎn)移到24孔板(大概2天長(zhǎng)滿)舞吭,再取24孔板的一半提DNA或者蛋白,更少細(xì)胞量沒(méi)有嘗試析珊。測(cè)序結(jié)果區(qū)分多克隆和單克隆雜合子:前者峰形雜亂無(wú)規(guī)則羡鸥,后者套峰規(guī)則且比例固定,也可以連T載體確定一下忠寻。

    CRISPR-Cas9基因編輯7--測(cè)序驗(yàn)證敲除

    前言: 使用挑單克隆技術(shù)得到多個(gè)單克隆細(xì)胞系后惧浴,就要開(kāi)始驗(yàn)證敲除,除了蛋白表達(dá)水平的檢測(cè)奕剃,最終還是要看測(cè)序結(jié)果衷旅。關(guān)于測(cè)序的方案也是各有不同捐腿,由于之前選用的是CRISPR-Ca...

  • 明白了 謝謝春卷老師(●'?'●)

    CRISPR-Cas9基因編輯7--測(cè)序驗(yàn)證敲除

    前言: 使用挑單克隆技術(shù)得到多個(gè)單克隆細(xì)胞系后,就要開(kāi)始驗(yàn)證敲除芜茵,除了蛋白表達(dá)水平的檢測(cè)叙量,最終還是要看測(cè)序結(jié)果。關(guān)于測(cè)序的方案也是各有不同九串,由于之前選用的是CRISPR-Ca...

  • 春卷老師好绞佩,關(guān)于單克隆鑒定,有幾點(diǎn)想請(qǐng)教:
    1.96孔板內(nèi)的細(xì)胞是否不夠提DNA猪钮?
    2.96孔板內(nèi)細(xì)胞擴(kuò)出來(lái)推薦是用24孔板 or 12孔板 or 6孔板品山?
    3.對(duì)于測(cè)序套峰的是否無(wú)法區(qū)別是單克隆雜合子還是多個(gè)克隆長(zhǎng)成的?
    4.一直沒(méi)有太理解為什么連接T載體可以進(jìn)一步鑒定??
    謝謝春卷老師烤低,感激不盡~~

    CRISPR-Cas9基因編輯7--測(cè)序驗(yàn)證敲除

    前言: 使用挑單克隆技術(shù)得到多個(gè)單克隆細(xì)胞系后肘交,就要開(kāi)始驗(yàn)證敲除,除了蛋白表達(dá)水平的檢測(cè)扑馁,最終還是要看測(cè)序結(jié)果涯呻。關(guān)于測(cè)序的方案也是各有不同,由于之前選用的是CRISPR-Ca...

  • @74640e63c49c 我也正在挑單克隆 確實(shí)單個(gè)細(xì)胞長(zhǎng)出來(lái)的孔就不多... 還要再驗(yàn)證工作量也很大... 共勉 ??

    CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA設(shè)計(jì)

    大佬說(shuō)腻要,我只說(shuō)一次复罐,你自己要記住以最火熱的p53為例 Step 1 先找p53基因序列 1. NCBI--輸入p53并選擇物種human:tumor protein p53 ...

  • @凍春卷 嗯嗯明白了 謝謝春卷老師~ 后面也想做library的screening 希望能多多交流??

    CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA設(shè)計(jì)

    大佬說(shuō),我只說(shuō)一次雄家,你自己要記住以最火熱的p53為例 Step 1 先找p53基因序列 1. NCBI--輸入p53并選擇物種human:tumor protein p53 ...

  • @74640e63c49c 您好 不知道你是否這樣做了 想請(qǐng)教下把同一基因不同靶點(diǎn)做成pool包病毒后去感染目的細(xì)胞效诅,是否可能一個(gè)目的細(xì)胞內(nèi)進(jìn)了多個(gè)病毒(包含多個(gè)靶點(diǎn)的sgRNA),然后該基因同時(shí)發(fā)生多個(gè)靶點(diǎn)的NHEJ趟济,這樣KO效率是否會(huì)高于感染單一病毒乱投?

    CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA設(shè)計(jì)

    大佬說(shuō),我只說(shuō)一次顷编,你自己要記住以最火熱的p53為例 Step 1 先找p53基因序列 1. NCBI--輸入p53并選擇物種human:tumor protein p53 ...

  • 還有很多其他的設(shè)計(jì)sgRNA的網(wǎng)站戚炫,比如CHOPCHOP & CCTop 可以去這些里面看看,還有一些更偏門的軟件設(shè)計(jì)勾效,總之不止zhang lab的這個(gè)設(shè)計(jì)工具的嘹悼。

    CRISPR-Cas9基因敲除sgRNA設(shè)計(jì)

    大佬說(shuō),我只說(shuō)一次层宫,你自己要記住以最火熱的p53為例 Step 1 先找p53基因序列 1. NCBI--輸入p53并選擇物種human:tumor protein p53 ...

  • @凍春卷 好的好的 非常感謝您~ 這個(gè)系列是我新手上路最大的救星 我繼續(xù)把后面的看完可能有些問(wèn)題就解開(kāi)了。真的非常感謝這個(gè)系列的文章???????峦筒。

    CRISPR-Cas9基因編輯2--gRNA設(shè)計(jì)(下)

    簡(jiǎn)介和前期文章 我對(duì)之前的所有教程進(jìn)行了再次詳細(xì)的總結(jié)CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設(shè)計(jì)(上) 前言: 在上一次文章中究西,我們已經(jīng)得到了在線工具設(shè)計(jì)的sgR...

  • 春卷老師好,我的目的細(xì)胞不是293T物喷,我在確定質(zhì)粒構(gòu)建好了后卤材,能夠直接轉(zhuǎn)我的目的細(xì)胞,就省區(qū)轉(zhuǎn)293T這一步峦失?新手上路扇丛,非常感謝~

    CRISPR-Cas9基因編輯4--確定Cas9質(zhì)粒構(gòu)建成功+漂亮的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染

    簡(jiǎn)介和前期文章 我對(duì)之前的所有教程進(jìn)行了再次詳細(xì)的總結(jié)CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設(shè)計(jì)(上)[http://www.reibang.com/p/e5c...

  • 春卷老師好,最后一part設(shè)計(jì)檢測(cè)所需引物尉辑,是在CRISPR/cas9載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞后提取細(xì)胞基因組DNA后做PCR的引物嗎帆精?以及這PCR的目的是什么呢?擴(kuò)增成長(zhǎng)片段后送去測(cè)序嗎隧魄?
    新手上路卓练,不勝感激~~

    CRISPR-Cas9基因編輯2--gRNA設(shè)計(jì)(下)

    簡(jiǎn)介和前期文章 我對(duì)之前的所有教程進(jìn)行了再次詳細(xì)的總結(jié)CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設(shè)計(jì)(上) 前言: 在上一次文章中,我們已經(jīng)得到了在線工具設(shè)計(jì)的sgR...

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