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計(jì)算測(cè)序深度和覆蓋度
深度（depth）與覆蓋度（coverage） 假想實(shí)驗(yàn) 對(duì)長(zhǎng)100bp的目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲測(cè)序：采用單端測(cè)序舆蝴，每個(gè)read長(zhǎng)5bp慌盯；總共得到了200個(gè)reads乡洼；把所有的re...
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跟菜菜一起學(xué)機(jī)器學(xué)習(xí)吧~ B站有課件對(duì)應(yīng)視頻哦：https://www.bilibili.com/video/BV1vJ41187hk
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專(zhuān)注技術(shù)傳播了赌，全媒體平臺(tái)同名
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常規(guī)RNAseq分析流程與問(wèn)題歸納
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用clusterProfile進(jìn)行非模式物種且沒(méi)有參考基因組的GO和KEGG富集分析
新組裝的基因組并沒(méi)有上傳和生成RefSeq基因組信息嫂拴。而且一系列需要or.db或者構(gòu)建or.db的步驟嘗試構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)都不成功播揪，要么缺乏物種信息，要么缺乏gene symbol...
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一起學(xué)畫(huà)圖：氣泡圖—常用于富集分析
公眾號(hào)原文點(diǎn)我[https://mp.weixin.qq.com/s/sVWseQoyxL5tEM5PDf-iuQ] Part 1 ：氣泡圖 氣泡圖是散點(diǎn)圖的一種變體筒狠，一般的...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中的秩和檢驗(yàn)與t檢驗(yàn)在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析的過(guò)程中辩恼，尋找差異基因的過(guò)程需要用到對(duì)基因統(tǒng)計(jì)的假設(shè)檢驗(yàn)（例如函數(shù)FindAllMarkers中的test.use參數(shù)）雇庙，我們這里來(lái)深入了解一下假設(shè)檢驗(yàn)的方法...
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R語(yǔ)言ggplot2一幅好看的頻率分布直方圖實(shí)例推文內(nèi)容來(lái)自于鏈接 https://www.andrewheiss.com/blog/2021/12/18/bayesian-propensity-scores-weight...
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@調(diào)包俠_8717 請(qǐng)問(wèn)您一下 這軟件能對(duì)INDEL基因型填充么？
用Beagle做基因型填充（Imputation）
在學(xué)習(xí)基因型填充之前需要了解一下什么是Phasing（基因定相灶伊、單倍體分型）疆前，主要是參考公眾號(hào)堿基礦工中的一篇文章：人類(lèi)基因組的Phasing原理是什么。建議多讀幾遍 Pha...
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這個(gè)世界流行離開(kāi)，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
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