很久不做單細胞相關(guān)的分析了啄巧，一些操作還停留在seurat R包v3, v4的版本，最近剛新裝的seurat已經(jīng)是v5了誓军，很多操作和之前也不一樣了辙谜，我在轉(zhuǎn)換中沒少折騰郭脂，下面列舉...
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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單細胞數(shù)據(jù)由R中的seurat的格式轉(zhuǎn)為Python中scanpy可以識別的格式
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使用scVelo進行RNA velocity分析-01scVelo于2020年發(fā)表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3]零渐，...
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平常做點 ?珍珠翡翠白玉湯? 你要是不介意的話也來一碗嘗嘗~<br><br>裝逼的戴著R形狀的戒指??<br>牽著??/?? 駱駝慢悠悠的逛街<br>后來碰到了一條蛇??纏著我不放<br><br>??____???3??_???3???3______?? ??____<br><br>那好吧，都一起來重罪，跟著我種白菜吧砸泛！<br>╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪<br>╪ ?? ???? ?? ?? ?? ?? ?? |<br>╪ ?? ?? ?? ???? ?? ?? ?? |<br>╪ ?? ?? ?? ???? ?? ?? ?? |<br>╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪=╪<br><br>
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TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選围俘，多因素cox建模砸讳，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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maftools里怎么沒有tmb這個函數(shù)啊
腫瘤突變負(fù)荷計算
0.腫瘤突變負(fù)荷(TMB)[http://222.70.95.243:6893/files/TMB/TMB.html#%E8%82%BF%E7%98%A4%E7%AA%81%...
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Python腳本：fasta文件多序列信息統(tǒng)計
設(shè)計需求 統(tǒng)計fasta文件中多條序列信息常遂，設(shè)計目標(biāo)效果： 將結(jié)果輸入到csv格式的表格中，因為csv格式表格用挽荠，分隔數(shù)據(jù)克胳。腳本使用argparse模塊平绩，提示輸入數(shù)據(jù)。 讀取...
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SNP數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹大概是長期的不鍛煉使得今天的爬山運動過量了漠另，接著悲劇就是無法入眠捏雌。也幸虧明天是周日，干脆就起床碼字了笆搓⌒允總結(jié)下自己前面用snp構(gòu)建系統(tǒng)進化樹的方法吧。 1.構(gòu)建進化樹的算法 構(gòu)...
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學(xué)習(xí)WES數(shù)據(jù)分析流程
參考學(xué)習(xí)資料：筆記視頻教程知識庫 首先安裝軟件 先安裝conda少孝，使用清華的conda，說明書：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/he...
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Hallmarks of Cancer: The Next Generation
https://mp.weixin.qq.com/s/XZvkAAgtbgHR1TS8VozjUw https://www.nature.com/articles/s4158...
