Original 表觀遺傳學習小組 Epigenetics表觀遺傳學 本文根據(jù) 2016 年 8 月復旦大學倪挺教授在「表觀基因組學暑期國際講習班」中的報告整理而成,本文采用...
病人樣本數(shù):360 測序深度: 80 (測序得到的堿基總量(bp)與基因組大杏蚶摹(Genome)的比值,它是評價測序量的指標之一蜈抓。) 整體體細胞突變數(shù)從0.05到16.1(p...
最近打算開始寫一個多組學(包括宏基因組/16S/轉錄組/蛋白組/代謝組)關聯(lián)分析的R包叽唱,避免重復造輪子屈呕,在開始之前隨便在網(wǎng)上調(diào)研了下目前已有的R包工具,部分羅列如下: 1. ...
劉小樂老師課題組發(fā)布了一個用于預測差異表達或共表達基因集的轉錄調(diào)控子的工具Lisa文章為:《Lisa: inferring transcriptional regulator...
作者:ahworld鏈接:SCENIC | 以single-cell RNA-seq數(shù)據(jù)推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡和細胞功能聚類)來源:微信公眾號著作權歸作者所有萎胰,任何形式的轉載都請聯(lián)...
前言 我在2019年3月份寫過一篇這樣的文章(一文讀懂scRNA-Seq)到底要花多久時間才能看懂一套單細胞測序數(shù)據(jù)結果?技竟,并在文末許諾冰肴,對PPT感興趣的小伙伴可以留言詢要P...
Part0背景知識 Q:什么是外顯子測序呢搓扯?A:外顯子組測序是指利用序列捕獲或者靶向技術將全基因組外顯子區(qū)域DNA富集后再進行高通量測序的基因組分析方法检痰。外顯子組包含約1%的...