多啦A夢的時光機(jī)_648d

一：軟件安裝 二：程序運(yùn)行 1.wgd mcl鑒定基因組內(nèi)的同源基因 輸出文件夾里面有兩個文件： *.tsv: BLASTP的outfmt6輸出結(jié)果*.tsv.mcl: MC...

扇子和杯子

1. 組裝基因組質(zhì)控 得到組裝好的基因組序列之后，首先要使用多種方法評估組裝質(zhì)量施敢。這里用到2款可用于基因組組裝質(zhì)量評估的軟件——QUAST和BUSCO子房。 1.1 quast—...

Mr_我愛讀文獻(xiàn)

推斷物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系以及分歧時間對探討物種起源與演化具有重要意義。通過最大似然法（ML）構(gòu)建物種進(jìn)化樹以及估算物種分化時間在比較基因組學(xué)的研究進(jìn)展中已經(jīng)成為了必不可少的“套路...

生信師姐

生物多樣性包括 物種多樣性奥裸、遺傳多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性险掀，其成因是生物學(xué)中的核心問題之一。陸地環(huán)境中湾宙，山區(qū)生態(tài)系統(tǒng)蘊(yùn)藏著異常多樣的陸地生物多樣性樟氢，可能的解釋包括巨大的海拔梯度變...

Mr_我愛讀文獻(xiàn)

前幾天，實(shí)驗(yàn)室的師弟師妹通過本地blast獲取一些沒有基因組注釋物種的蛋白編碼序列侠鳄。原本以為可以快速地進(jìn)行下一步的選擇壓力分析埠啃，沒想到卻在多序列比對這一環(huán)節(jié)出現(xiàn)了棘手的問題。...

xuzhougeng

基因組組裝 基因組組裝一般分為三個層次伟恶，contig, scaffold和chromosomes. contig表示從大規(guī)模測序得到的短讀(reads)中找到的一致性序列碴开。組...

生信師姐

轉(zhuǎn)自：https://mp.weixin.qq.com/s/8t7rNrp82tnoTW5LN_ck3g[https://mp.weixin.qq.com/s/8t7rNrp...

九心_

前言 無論是寫代碼還是腳本知押，當(dāng)我們要處理字符串或者提煉重要信息的時候叹螟，正則表達(dá)式都可以是我們的好幫手。 不過很多同學(xué)都有一種這樣的感觸台盯，正則 = 天書 罢绽，比如下面的郵箱表達(dá)式...