今天這個小tip還挺實用的我早上正在使用筆記本電腦上網牺弄,突然往斷了,各種wifi 都連接不上去敛纲,然后設置了網絡reset之后够委,更加連信號都搜不到了扰魂。 這要是在開會或者有正事傅物,...
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看你的需求夯辖,群體水平質控最好一起吧
2018-11-01GWAS實戰(zhàn)(四)plink 進階之數據過濾數據好不好,影響到結果的準確性挟伙,所以我們要來對數據進行過濾楼雹,過濾前模孩,我們應該對數據的部分特征進行統(tǒng)計描述尖阔,以此為依據來進行過濾贮缅。 這里介紹的幾個指標:1.individual...
最小等位基因頻率和為什么要過濾 最小等位基因頻率怎么計算崎场?比如一個位點有AA或者AT或者TT,那么就可以計算A的基因頻率和T的基因頻率遂蛀,qA + qT = 1谭跨,這里誰比較小,...
最近真的有點倒霉李滴,骨折了螃宙,已經躺了好多天,所有的事情都暫停了下來所坯。 可能這就是命運吧谆扎,讓我老老實實呆在家中,哪里也去不了芹助。 北京之行也直接中斷了堂湖,好在已經把EigenGWAS...
這幾天一直在上海 北京交流,和很多實驗室的老師同學一起討論問題状土,感覺學到了非常多的知識苗缩。 雖然EigenGWAS 已經基本成型,在線網站 www.eigengwas.com[...
1.Linux服務器安裝Aspera Note:如果服務器無法用其中一個版本的Aspera声诸,建議更換Aspera的版本酱讶。參考:http://www.reibang.com/...
這個其實在服務器聯(lián)網的狀態(tài)下,操作起來十分簡單 首先給服務器安裝conda 然后用conda安裝gffread 安裝好之后彼乌,一條命令搞定 反過來也可以 如果沒有l(wèi)inux系統(tǒng)...
不知不覺又過了一年泻肯,人總是容易懈怠和疲倦,但是每次想起來慰照,還是之前認認真真學習記錄的時候最踏實灶挟。今天記錄一下IQ TREE的使用 其實IQtree的網站做的很好,很方便學習:...
問題描述:有些物種毒租,基因組拼接的可能不是很好稚铣,或者說,在基因注釋的時候,沒有注釋的很清楚惕医,這個時候會懷疑直接從基因組fasta文件和gff3文件中提取的基因是有問題的耕漱,那么如...
1.用戶管理 2.權限管理 3.磁盤管理 4.進程管理 5.服務器安全 問題描述:Linux個人賬戶由于密碼設的過于簡單導致被人入侵。個人賬號一提交命令就被kill掉參考:h...
寫在前面 用過 BLAST 進行基因功能注釋的朋友應該常常遇到兩個問題: BLAST 輸出格式較多抬伺,選擇哪一類輸出格式更為實用螟够? 輸出結果信息較多,如果方便下游數據分析峡钓? B...
1.gffcompare軟件介紹 當與參考注釋文件進行比較時妓笙,gffcompare可用于比較、合并能岩、注釋和估計一個或多個GFF文件的準確性寞宫。 2.gffcompare軟件使用...
對于畫進化樹辈赋,其實有很多的軟件和方法,有命令行的毛俏,也有可視化界面的炭庙,還有在線網站(iTol)這樣在線美化的,但是對于生信小白來說煌寇,最重要的是先上手焕蹄,這里簡單記錄一下,最快速度...
這個沒有特定的阀溶,你根據自己的需要設置就行
2018-11-05 GWAS實戰(zhàn)(六)plink 進階之主成分分析和群體分層要學習這一節(jié)腻脏,首先是要學習什么是主成分,什么是聚類這個我一直有點搞混银锻,可以百度谷歌查一查http://www.cnblogs.com/pinard/p/6239403.htm...
在最初學習深度學習的時候,比較容易混淆三個概念Epoch Batch Iteration如果對這三個概念沒有一個清晰的認識的話, 在看別人文章的時候,很容易犯糊涂 Epoch...
一般來說,拿到計算機以后击纬,需要先看一下電腦的配置鼎姐,這里主要學習一下看CPU的信息和內存的使用情況: CPU 首先要了解 CPU的一些基礎知識百度百科里面都有 CPU的基礎...
本次主要來理解一下什么是鏈特異性文庫,為什么要構建這種文庫更振。 首先要明確幾個概念炕桨,對理解后面的講解很有幫助: 基本概念 正鏈(forward strand): 我們可以理解為...