matrix matrix > data.frame matrix > dist data.frame > dist dist > matrix原來的自我距離統(tǒng)一轉(zhuǎn)成0 di...
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R: data.frame dist matrix轉(zhuǎn)換
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啦啦啦，每天睡到自然醒吧
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R 常用微生物距離函數(shù)記錄
總結(jié)：第1蔚润、6、7距離算法較多，但是1計(jì)算距離前無法對(duì)原始OTU進(jìn)行hellinger轉(zhuǎn)換，相反6和7均可以驯击，但是7操作步驟稍顯復(fù)雜，使用6更快捷方便ps：怎么做hellin...
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不斷學(xué)習(xí)，不斷忘記广辰，不斷回顧暇矫，不斷進(jìn)步，這便是凡人的學(xué)習(xí)方式,或謂曰：Attention is all you need,but learning is all your attention.
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[R] 如何快速生成許多差異明顯的顏色择吊？這個(gè)需求真的太常見了李根！注意問題強(qiáng)調(diào)的幾個(gè)關(guān)鍵詞：一是快速，二是大量几睛，三是差異明顯房轿。在生成大量元素比較圖時(shí)要明顯區(qū)分不同樣本，比如宏基因組中的物種分析： 方法一：自定義 自定義...
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XCAVATOR檢測(cè)CNVXCAVATOR 軟件 檢測(cè)CNV的方法 當(dāng)前所森，檢測(cè)SV的主要方法有如下4種： 1.1 read count/depth of coverage (RC/DOC) 根據(jù)讀段在...
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@Silver_42ac conda 會(huì)自動(dòng)匹配適合的版本
GATK4 conda 安裝
conda 直接gatk并不完整囱持，總會(huì)有問題，這里提供摸索后的conda安裝解決方法 gatkcondaenv2 文件內(nèi)容
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根據(jù)gatkcondaenv.yml 中的版本填寫就行了焕济，我這里主要是 intel-openmp 版本與其它依賴沖突
安裝匯總遇到的版本不兼容纷妆，就把指定的版本號(hào)，如“intel-openmp=1.2” 改為 intel-openmpGATK4 conda 安裝
conda 直接gatk并不完整吼蚁，總會(huì)有問題凭需，這里提供摸索后的conda安裝解決方法 gatkcondaenv2 文件內(nèi)容
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不再更新
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個(gè)人主頁：hbox.cool
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MetaPhlAn4 Meta taxonGithub: https://github.com/biobakery/MetaPhlAn/wiki/MetaPhlAn-4[https://github.com/biob...
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生信博士生一枚，分享科研代碼能曾，經(jīng)驗(yàn)度硝。推文一般很長(zhǎng)，努力將一個(gè)問題講全面寿冕，感謝你的耐心閱讀蕊程。
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diamond提速
安裝使用 比對(duì)nr庫 提速辦法 親測(cè)增加 --block-size 15 --index-chunks 1這兩個(gè)參數(shù)后速度提升10倍以上。 參考：使用DIAMOND將全基因組...
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連雨不知春去，一晴方覺夏深
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南京大學(xué)生物學(xué)，佛系更新~
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在寫了（行數(shù)1，字?jǐn)?shù)0）不恭。
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心有明月换吧，諸事無悔浑娜。愿執(zhí)螢火，仰望星空式散。已轉(zhuǎn)生活號(hào)。
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【軟件安裝】interproscan-5.59-91.0
【1】conda 安裝 存在問題 share/InterProScan/bin/prosite/pfsearchV3 依賴GLIBC_2.27 GLIBC_2.27 not ...
