因?yàn)镃IDP需要目的序列,對(duì)于沒有生信基礎(chǔ)的同學(xué)來說從基因組提取序列是一個(gè)相對(duì)痛苦的過程腺怯。所以給同學(xué)們?cè)O(shè)置了序列提取模塊吐绵。請(qǐng)同學(xué)們進(jìn)行軟件安裝以...
基本過程是設(shè)計(jì)完sgRNA后需要將sgRNA插入到載體序列中眠副,這個(gè)時(shí)候就涉及到了插入哪個(gè)位點(diǎn)的問題腾啥。因?yàn)橥瑢W(xué)們手中可能有各種各樣的載體芋类,所以在這...
各位老師霜旧、同學(xué)错忱,大家好,今天向大家推出一款我最新開發(fā)的挂据、用于CRIPSR系統(tǒng)中sgRNA設(shè)計(jì)的軟件以清,CIDP。 還是老規(guī)矩棱貌,首先向同學(xué)們介紹為什...
老規(guī)矩玖媚,先和同學(xué)們介紹一下為什么要做這么一款軟件?基因組比對(duì)paf格式文件: 當(dāng)同學(xué)們需要進(jìn)行基因組層面的序列比較時(shí)婚脱,通常要面對(duì)如上所示的比對(duì)結(jié)...
后來發(fā)現(xiàn)今魔,即便努力實(shí)現(xiàn)了各科代表物種的注釋,但在某些情況下還是直接注釋可能更方便些障贸。于是對(duì)GFAP添加了一個(gè)新的模塊错森,該模塊直接用pfam, G...
早年用一些外國軟件的時(shí)候總是希望能夠找到漢化版本,到自己做軟件了篮洁,反而忽視了這個(gè)問題涩维。既然本照著為同學(xué)們解決問題的原則,今天終于將GFAP進(jìn)行了...
嗯袁波,與上一章(GFAP---Transcription factor)的基本操作相同瓦阐,不浪費(fèi)同學(xué)們寶貴的時(shí)間了。區(qū)別點(diǎn)在于篷牌,該模塊所針對(duì)是非轉(zhuǎn)錄...
對(duì)于一些沒有生信基礎(chǔ)的同學(xué)來說睡蟋,想要從一堆未知功能的基因中挑選出想要的轉(zhuǎn)錄因子,可能還要花費(fèi)大量的時(shí)間成本去學(xué)習(xí)這個(gè)過程枷颊。而轉(zhuǎn)錄因子又在植物中起...
該模塊主要用于KEGG分析以及作圖戳杀。首先,需要得到相應(yīng)基因的KEGG以及KO IDs: 輸入文件是先前的比對(duì)文件夭苗,選擇近緣物種信卡,然后保存并命名,...