langchain 基于 0.0.109 版本 一個(gè)基于LLMs的應(yīng)用程序開(kāi)發(fā)框架, 通過(guò)可組合性來(lái)使用LLM構(gòu)建應(yīng)用程序. 其重點(diǎn)在于"可組合性" 大型語(yǔ)言模型 (LLM...
IP屬地：浙江
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大模型上層工具鏈調(diào)研 - langchain, llama-index
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scoop——強(qiáng)大的Windows命令行包管理工具
2020年3月1日調(diào)整文章邏輯順序刻撒，增加aria2 16線程下載瞒大。 在下載了一系列軟件管理專家后台谊，我遇到了scoop這一個(gè)神級(jí)的軟件包管理工具胆筒，他會(huì)自動(dòng)設(shè)置環(huán)境變量，也會(huì)管理...
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為什么說(shuō)FPKM和RPKM都錯(cuò)了？
這本是三年多之前我發(fā)在公眾號(hào)上的一篇舊文，一些偶然的機(jī)會(huì)跋炕，發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個(gè)問(wèn)題，因此我重新做了梳理并發(fā)出來(lái)律适。這樣的討論是有益的辐烂，放在今天也不過(guò)時(shí)，我也愿意和更多的朋友...
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RPKM/FPKM/TPM標(biāo)準(zhǔn)化方法區(qū)別
幾種豐度計(jì)算方法 feature 定義: 基因組上對(duì)具有不同性質(zhì)區(qū)域的定義(例如: gene/exon/intron/miRNA等)捂贿。優(yōu)點(diǎn): 利于分類(lèi)整理結(jié)果纠修。 兩類(lèi)測(cè)序bi...
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小技巧4-控制繪圖區(qū)大小（ggplot2）
基于ggplot2的繪圖導(dǎo)出時(shí)厂僧，可以指定整張圖像的大小分瘾，這里不做贅述。 本文所指繪圖區(qū)是指坐標(biāo)軸之間的繪圖區(qū)，不含圖例區(qū)德召，標(biāo)題區(qū)，標(biāo)簽區(qū)汽纤。即橫縱坐標(biāo)之間框柱的區(qū)域上岗。 導(dǎo)出單張...
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linux之文本內(nèi)容替換命令sed
sed簡(jiǎn)介：流編輯工具，用來(lái)對(duì)文本進(jìn)行過(guò)濾與替換操作蕴坪。 sed流程：sed通過(guò)一次僅讀取一行內(nèi)容來(lái)對(duì)某些指令進(jìn)行處理后輸出肴掷。 1、sed通過(guò)文件或管道讀取文件內(nèi)容背传，但sed默...
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聽(tīng)說(shuō)你的纱粽埃基圖也無(wú)法保存？
之前寫(xiě)過(guò)畫(huà)删毒粒基圖和網(wǎng)絡(luò)圖的推文：http://www.reibang.com/p/ff295d3444b4[http://www.reibang.com/p/ff295d...
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sed+正則表達(dá)式 替換文本文件
使用sed + 正則表達(dá)式批量匹配并替換文本內(nèi)容 創(chuàng)建文件 text.txt 替換 「world」為 Moto 替換「1.1.2-a1b2c3d」 使用正則表達(dá)式sed -i...
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RDA分析原理1. RDA的基本方法描述 冗余分析（RDA）和基于轉(zhuǎn)化的冗余分析（tb-RDA） Rao（1964）首次提出冗余分析（Redundancy analysis痴脾，RDA），從概...
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【KEGG-1】KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)
歡迎關(guān)注公眾號(hào)oddxix KEGG 簡(jiǎn)介 KEGG全稱: Kyoto Encyclopedia of Genes and GenomesKEGG是一個(gè)整合了基因組梳星、化學(xué)和系...
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使用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫(xiě)的R包赞赖，看過(guò)了它的繪圖就會(huì)使人沉迷于其顏值無(wú)法自拔。本文很多內(nèi)容直接翻譯自官方文檔冤灾，加上了我的測(cè)試數(shù)據(jù)（還是以果蠅為例）前域。 一、...
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記錄和分享工作、科研上的技能和方法归粉！在此之余椿疗，也希望能幫到有同樣疑問(wèn)的小伙伴！<br>微信公共號(hào)：YJY技能修煉<br>特別喜歡的一句話: 生如螻蟻當(dāng)立鴻鵠之志盏浇，命薄似紙應(yīng)有不屈之心变丧。
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R繪圖|pheatmap熱圖繪制——基礎(chǔ)篇
清除環(huán)境及安裝R包 讀入數(shù)據(jù)并做簡(jiǎn)單處理 繪圖并輸出結(jié)果 顏色設(shè)置 修改熱圖顏色1 修改熱圖顏色2 修改熱圖顏色3 顯示基因名稱 以上數(shù)據(jù)非常多，選擇部分?jǐn)?shù)據(jù)繪圖 調(diào)整格子大...
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Adonis與ANOSIM檢驗(yàn)究竟是什么绢掰？做微生物16S測(cè)序的時(shí)候痒蓬，公司的報(bào)告里經(jīng)常會(huì)給到兩種檢驗(yàn)Adonis和ANOSIM，聽(tīng)過(guò)t.test滴劲、wilicox攻晒、anova各種檢驗(yàn)，那么Adonis和ANOSIM檢驗(yàn)是...
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搬磚的工人<br>
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IQ-TREE最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的神器IQ-TREE：最大似然法構(gòu)建精確、快速萧芙、靈活给梅、廣泛的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) IQ-TREE自2011年就已經(jīng)開(kāi)發(fā)并開(kāi)源假丧，至今都有專業(yè)團(tuán)隊(duì)維護(hù)，其名字來(lái)源于IQPNNI和TREE-PUZ...
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從零開(kāi)始學(xué)Circos繪制圈圖（一）一般基因組文章都會(huì)有下面這種酷炫圖动羽，用來(lái)描述基因組的基因密度分布包帚，轉(zhuǎn)座子的密度分布，和其他物種或者多倍體的多套染色體間的共線性關(guān)系运吓，以及其他各種你只要測(cè)序就能加上的信息渴邦，比如...
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根據(jù)vcf文件計(jì)算SNP密度并用circlize可視化結(jié)果參考 收集vcftools所有用法 命令 100000 是指定窗口長(zhǎng)度--out 是輸出文件的前綴 使用R語(yǔ)言中的circlize包畫(huà)圖 參考 用circlize包繪制cir...
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跟著Nature Genetics學(xué)作圖：使用ggarrange包對(duì)ggplot2的多個(gè)圖進(jìn)行組合論文 Plasma proteome analyses in individuals of European and African ancestry identify ci...
