240 發(fā)簡信
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  • 感謝老師分享稳懒,請問在計算系統(tǒng)發(fā)育信號的部分耍缴,Pagel‘s lambda得到最佳模型是BM之后诊杆,請問如何知道lambda的具體數(shù)值呢牧氮?得到calculate AIC weights之后該怎么進一步計算呢?非常感謝娃殖!

    系統(tǒng)發(fā)育比較分析—R

    系統(tǒng)發(fā)育樹是研究物種進化歷史必不可少的信息定庵,我們可以利用它得到一些重要歷史線索,如: 生物多樣性(物種形成或滅絕)锣光; 物種性狀進化與多樣化(Character evoluti...

  • 您好誊爹,請問您運行成功了么蹬刷,這里pileus and substrate.txt文件格式是怎樣的呀,我用我的文件運行時一直提示“incorrect number of dimensions”频丘。??????

    phytools祖先狀態(tài)重建

    最近做了一個祖先狀態(tài)重建的工作办成,還是蠻有意思的。PS:需要說一下的是椎镣,RASP的祖先狀態(tài)重建主要是分布區(qū)重建诈火,用RASP的模型去做性狀重建會出現(xiàn)非常奇怪的結(jié)果,顧換成R語言來...

  • 感謝分享,請問pileus and substrate.txt文件格式是怎樣的呀惊科,我的文件大概是Aster_a L
    Erigeron_a L
    Lagenophora_s F
    Monoptilon_b L …………運行時一直提示“incorrect number of dimensions”??????

    phytools祖先狀態(tài)重建

    最近做了一個祖先狀態(tài)重建的工作拍摇,還是蠻有意思的。PS:需要說一下的是馆截,RASP的祖先狀態(tài)重建主要是分布區(qū)重建充活,用RASP的模型去做性狀重建會出現(xiàn)非常奇怪的結(jié)果,顧換成R語言來...

  • 請問沒有參考基因組的情況該怎么統(tǒng)計呢蜡娶?

    如何獲取測序數(shù)據(jù)的average insert size

    在學習用SOAPdenovo2組裝基因組的過程中混卵,發(fā)現(xiàn)配置文件需要填average insert size這一項。建庫過程我是沒有參與的窖张,所以就不知道insert size到...

  • @土雕藝術(shù)家 謝謝您幕随,我昨天換了1.8也成功運行了

    BBMap/BBTools安裝 2023-02-17

    BBMap/BBTools官網(wǎng)下載通道https://jgi.doe.gov/data-and-tools/software-tools/bbtools/bb-tools-u...

  • 您好,請問下您使用的java是什么版本呀宿接?我使用的是openjdk version "1.7.0_75"赘淮,按照安裝流程安裝之后運行時一直報錯辕录,請問您了解是什么原因么?非常感謝梢卸!
    報錯如下:
    Creating merged reference file ref/genome/1/merged_ref_13990193281371715.fa.gz
    Exception in thread "main" java.lang.NoSuchMethodError: java.lang.Process.isAlive()Z
    at dna.Data.testExecute(Data.java:1829)
    at dna.Data.BGZIP(Data.java:1517)
    at fileIO.ReadWrite.getGZipOutputStream(ReadWrite.java:533)
    at fileIO.ReadWrite.getOutputStream(ReadWrite.java:382)
    at fileIO.TextStreamWriter.<init>(TextStreamWriter.java:55)
    at fileIO.TextStreamWriter.<init>(TextStreamWriter.java:32)
    at fileIO.TextStreamWriter.<init>(TextStreamWriter.java:28)
    at align2.BBSplitter.mergeReferences(BBSplitter.java:410)
    at align2.BBSplitter.processArgs(BBSplitter.java:176)
    at align2.BBSplitter.main(BBSplitter.java:42)

    BBMap/BBTools安裝 2023-02-17

    BBMap/BBTools官網(wǎng)下載通道https://jgi.doe.gov/data-and-tools/software-tools/bbtools/bb-tools-u...

  • 請問您后來怎么解決的呀走诞,我手動安裝和用conda安裝都報這個錯

    BBtools的安裝和簡單使用

    [TOC] 安裝環(huán)境 Ubuntu18.10BBMap_38.31 安裝過程 from the terminal window/linux shell: Extract th...

  • 非root權(quán)限下安裝vcftools并使用vcf-query

    使用https://github.com/vcftools/vcftools下載的安裝包安裝時需要root權(quán)限猜欺,這時可以使用sourceforge中已編譯的包。 具體方法如下...

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