您好涧黄，這里是比較完整的步驟https://zhuanlan.zhihu.com/p/422628637
在NCBI上上傳葉綠體基因組Bankit（也可使用該項上傳trnl-F序列） 在使用Bankit上傳葉綠體基因組時還需要準備一些前提文件： 第一個：...
IP屬地：山東
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基因結(jié)構(gòu)繪圖UTR寇荧、外顯子和內(nèi)含子位置和結(jié)構(gòu) 運用在線分析工具GSDS(Gene Structure Display Server)繪制基因內(nèi)含子-外顯子結(jié)構(gòu)圖網(wǎng)址：Gene Struc...
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可變剪切分析及可視化可變剪切的可視化 ggsashimi.py 從github https://github.com/guigolab/ggsashimi[https://github.com/...
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IGV繪制壽司圖（sashimi plot）前言： IGV（Integrative Genomics Viewer基因組瀏覽器）是一個將基因組學(xué)數(shù)據(jù)可視化的可交互工具亮元，具有圖形界面盏阶，高性能且易于使用∠敢疲可用于展示和查看基...
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getorganelle1.安裝getorganelle 2.安裝葉綠體基因組等數(shù)據(jù)庫 小插曲：在安裝參考基因組時發(fā)現(xiàn)報錯：ERROR: Blast is not available!當時以為是bl...
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不過這個軟件不是很大程梦，可以考慮在windows上裝個linux的虛擬機
ITSx軟件的安裝（提取ITS序列）
該軟件可以自動從序列中提取ITS1、ITS2借宵、5.8S的序列并標注位置幌衣，下面是這款軟件的安裝與使用方法。第一步 拼接核糖體基因組 第二步 下載ITSx安裝包 第三步 安裝軟件...
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@Hi彭于晏 emm，這好像是不行的
ITSx軟件的安裝（提取ITS序列）
該軟件可以自動從序列中提取ITS1豁护、ITS2哼凯、5.8S的序列并標注位置，下面是這款軟件的安裝與使用方法楚里。第一步 拼接核糖體基因組 第二步 下載ITSx安裝包 第三步 安裝軟件...
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R語言——相關(guān)性分析和熱圖繪制參考鏈接：https://mp.weixin.qq.com/suT5X_RbAildMmDM0W3R0sg[https://mp.weixin.qq.com/suT5X_Rb...
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@晚餐肉 您好断部，這里的sepcific_species是您所需要構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹中的外類群哦，就看您的外類群是哪個了班缎。
使用orthofinder查找單拷貝基因并建樹
本文主要是對這篇文章利用orthofinder尋找單拷貝基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹 - 簡書 (jianshu.com)[http://www.reibang.com/p/52c2...
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STRING中做蛋白質(zhì)互作（PPI）網(wǎng)絡(luò)調(diào)控圖及GO蝴光、KEGG分析1.什么是蛋白互作？ 在轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)的文獻中达址，我們經(jīng)常能夠看到這樣的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（proteinprotein interaction network虱疏，PPInetwo...
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看了下，我寫的確實是有一點跳躍苏携，很多基礎(chǔ)知識我沒有寫出來做瞪。其實也可以不用這么麻煩，如果你的服務(wù)器上安裝了conda或者miniconda,就可以使用conda install -c bioconda itsx=1.1.3命令進行安裝,可以節(jié)省很多不必要的麻煩右冻，安裝完成后可以直接使用ITSx -i test.fasta -o test命令進行提取装蓬，其中-i后是輸入文件，即你想要鑒定的序列纱扭，-o后是輸出文件的前綴
ITSx軟件的安裝（提取ITS序列）
該軟件可以自動從序列中提取ITS1牍帚、ITS2、5.8S的序列并標注位置乳蛾，下面是這款軟件的安裝與使用方法暗赶。第一步 拼接核糖體基因組 第二步 下載ITSx安裝包 第三步 安裝軟件...
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@云巔之上 這種情況是不是考慮一下重新測序一下呢，我也遇見過這種情況肃叶，實在沒辦法了重新送樣補測的
在NCBI上上傳葉綠體基因組
Bankit（也可使用該項上傳trnl-F序列） 在使用Bankit上傳葉綠體基因組時還需要準備一些前提文件： 第一個：...
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@吃個核桃補補腦 好的蹂随，謝謝建議，本人菜鳥一枚因惭，怕出錯所以才搞這么復(fù)雜
黃酮合成通路基因鑒定軟件gfanno安裝與使用
1. 背景 該軟件使用HMMSearch和BLASTP的經(jīng)典注釋流程岳锁，為了確保提供注釋參數(shù)的準確性，使用11種雙子葉植物蹦魔、7種單子葉植物和2種基部被子植物基因組構(gòu)建了三個數(shù)據(jù)...
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@云巔之上 可能不行激率，因為NCBI他們現(xiàn)在檢測比較嚴格，除了ATCG外的其他字符不能識別勿决，建議更換軟件或者調(diào)一下參數(shù)重新拼接下
在NCBI上上傳葉綠體基因組
Bankit（也可使用該項上傳trnl-F序列） 在使用Bankit上傳葉綠體基因組時還需要準備一些前提文件： 第一個：...
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黃酮合成通路基因鑒定軟件gfanno安裝與使用
1. 背景 該軟件使用HMMSearch和BLASTP的經(jīng)典注釋流程乒躺，為了確保提供注釋參數(shù)的準確性，使用11種雙子葉植物低缩、7種單子葉植物和2種基部被子植物基因組構(gòu)建了三個數(shù)據(jù)...
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CentOS Linux 8 - AppStream錯誤解決辦法
由于前期對服務(wù)器進行了系統(tǒng)重裝嘉冒，當時沒有完成一些配置，昨天我想使用yum命令安裝軟件時出現(xiàn)了這樣的報錯 經(jīng)過查詢可能是/etc/yum.repos.d/CentOS-Linu...