發(fā)簡信
IP屬地：重慶
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公眾號：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研寨腔，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組速侈、腫瘤免疫、單細胞組學(xué)
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WB實驗問題總結(jié)（Western blot蛋白質(zhì)印跡）
1.為什么我的細胞提取液中沒有目標(biāo)蛋白迫卢？ 答：原因有很多： a) 你的細胞中不表達這種蛋白質(zhì)倚搬，換一種細胞； b) 你的細胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了乾蛤，你必需加入PMSF每界，抑制蛋白酶...
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基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控
順式作用原件： DNA序列，位于基因序列的上游或下游家卖，不編碼蛋白眨层，僅提供作用位點 「啟動子，增強子上荡，調(diào)控序列」 反式作用原件： 調(diào)控基因表達的蛋白質(zhì)分子 「GTF趴樱，TF，ac...
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組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶SETD2 - MedChemExpress
近日，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所秦駿課題組與陸軍軍醫(yī)大學(xué)大坪醫(yī)院江軍主任逛薇、南京醫(yī)科大學(xué)王曉明教授的合作在Cancer Cell在線發(fā)表了題為 “SETD2 Restric...
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如何通過CHIP-seq分析鑒別基因啟動子和增強子
一永罚、表觀遺傳學(xué)的組蛋白修飾 染色體一個核小體由兩個H2A啤呼，兩個H2B议薪，兩個H3，兩個H4組成的組蛋白八聚體和147bp纏繞在外面的DNA組成媳友。組蛋白有很多修飾形式斯议，包括組蛋白...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心哼御，又辜負了努力
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ChIP-seq實踐（非轉(zhuǎn)錄因子，非組蛋白）在實戰(zhàn)之前焊唬，首先對CHIP-seq分析做一些了解恋昼，以下是從各個地方copy過來綜合起來的，有些散亂赶促，是我認為重要以及應(yīng)該了解的知識點液肌。chip-seq 實戰(zhàn)就跟在轉(zhuǎn)錄組和外顯...
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使用deeptools生成ChIP-seq信號熱圖與譜圖整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析時用到的工具。本文只對使用的工具用法進行簡單介紹鸥滨。 deeptools 提供了computeMatrix命令以計算特定基因組...
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生信技能樹婿滓，生信菜鳥團老速，jimmy
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記錄學(xué)習(xí)生信的點滴
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章箭窜。感謝這些簡友整理的生信分析流程！ 如果簡友投稿沒有被我收入專題谨湘，可能是我沒看到或者收入到其他針對性更強的專題中了绽快。望見諒芥丧！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的紧阔，查看的時候請點擊“最新收錄”然后進行查看。 ?? 全基因組測序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq续担、ChIP-Seq分析 ?? 單細胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進化樹構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細節(jié)的比如熱圖擅耽、曼哈頓圖的繪制等 ?? python、perl物遇、R的包的使用過程 ?? 具體工具的使用乖仇，比如GATK的使用過程 ?? 數(shù)據(jù)庫的挖掘方法憾儒，比如TCGA數(shù)據(jù)庫的使用 ?? 另外就是整個文章走下來的流程 ?? ?? ??
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您好起趾，歡迎訂閱“科研貓”！<br>致敬科研工作者警儒，貓一樣的精靈們训裆！<br>細致敏銳地“捕捉”科研思路；<br>“飛檐走壁”于各種崎嶇困境蜀铲；<br>文獻和數(shù)據(jù)大海里的“捕魚能手”边琉；<br>實驗室里孤獨的“夜行俠”和“潔癖精”；<br>本號记劝，旨在營造活躍的生物醫(yī)學(xué)科研交流平臺变姨，歡迎您的加入。
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生信學(xué)習(xí)筆記、腳本編程怒竿、實驗設(shè)計忧额、數(shù)據(jù)分析 ～～～ 生物信息領(lǐng)域的大雜燴～ 好大一鍋亂燉，快到我的額碗里來～ 好好學(xué)習(xí)愧口，天天學(xué)生信～
