生物信息學(xué)研究叠骑。
IP屬地：浙江
-
序列比對切油？你可能需要一個(gè)圖形化界面多重序列比對（Multiple-Sequence-Alignment , MSA）應(yīng)該是序列分析中最為基礎(chǔ)的操作了，筆者之前發(fā)了很大筆墨介紹了MAFFT這款軟件的使用（MAF...
-
本地化BLAST+進(jìn)行目標(biāo)序列比對舉個(gè)栗子??： 最近對擬南芥中的一個(gè)叫做CBF的基因非常感興趣剥纷，現(xiàn)在我想看看這個(gè)CBF基因在一個(gè)新測序的物種Am基因組上是否存在痹籍，Am中有幾個(gè)CBF基因？這樣的查找可以通過本地...
-
怎么分析盎扌蹲缠？
Bland-Altman Plots(一致性評價(jià))在R中的實(shí)現(xiàn)
假設(shè)有reader1 和reader2，分別對一定數(shù)量病人的某一影像指標(biāo)進(jìn)行評分悠垛，現(xiàn)在想看一下這兩位研究者評分的一致性线定，繪制Bland-Altman圖是一種較為直觀、簡單的方...
-
Bland-Altman Plots(一致性評價(jià))在R中的實(shí)現(xiàn)假設(shè)有reader1 和reader2确买，分別對一定數(shù)量病人的某一影像指標(biāo)進(jìn)行評分渔肩，現(xiàn)在想看一下這兩位研究者評分的一致性，繪制Bland-Altman圖是一種較為直觀拇惋、簡單的方...
-
R可視化——圖形繪制過程中如何實(shí)現(xiàn)局部放大周偎？數(shù)據(jù)及基礎(chǔ)圖形的繪制 1、數(shù)據(jù)——以R自帶數(shù)據(jù)集iris為例 2撑帖、基于ggplot2包繪制散點(diǎn)圖 局部放大效果的實(shí)現(xiàn) 1蓉坎、加載包——主要基于ggforce包實(shí)現(xiàn)圖形的局部放大...
-
-
在R中利用fasta序列構(gòu)建進(jìn)化樹“進(jìn)化樹的構(gòu)建怎么操作缴罗？”“那肯定是用MEGA爸觥！” 可是真的好麻煩啊面氓，要先比對再建樹兵钮，然后再進(jìn)行各種美化，習(xí)慣了R就用R解決吧舌界。 簡單Google之后發(fā)現(xiàn)R有現(xiàn)成的包可以完...
-
不出Rstudio, 實(shí)現(xiàn)從多序列比對到畫進(jìn)化樹本文是對前幾天的打臉打臉之處就在于發(fā)現(xiàn)了muscle的R包掘譬，從此不用再為序列比對東奔西跑—— Step 1. 從基因名拿到序列 這一步用到的包：biomaRt ，選擇用sym...
-
R語言升級到3.6.0后遇到的Bioconductor安裝問題
前言 目前R 3.6.1 都已經(jīng)preRelease了呻拌，我筆記本上的電腦也趕忙把R從3.5.4升級到3.6.0（當(dāng)然生產(chǎn)力相關(guān)環(huán)境還沒敢亂升級葱轩，畢竟升級一次R語言還是容易碰到...
-
-
260/280靴拱、260/230?含義
A260nm是核酸最高吸收峰的吸收波長复亏，最佳測量值的范圍為0.1至1.0。如果不在此范圍缭嫡，稀釋或濃縮樣品缔御，使之在此范圍內(nèi)；如果吸光度小于0.05妇蛀，檢查是否存 在操作因素（如移...
-
什么時(shí)候可以畢業(yè)?_?
-
qRT-PCR實(shí)驗(yàn)及數(shù)據(jù)分析qRT-PCR實(shí)驗(yàn)原理 RT-qPCR由普通PCR技術(shù)發(fā)展而來评架，它是在傳統(tǒng)PCR反應(yīng)體系中加入熒光化學(xué)物質(zhì)（熒光染料或者熒光探針）眷茁，根據(jù)各自不同的發(fā)光機(jī)制實(shí)時(shí)檢測PCR退火、...
-
企業(yè)培訓(xùn)計(jì)劃制定五大要點(diǎn)
企業(yè)培訓(xùn)計(jì)劃制定五大要點(diǎn) 培訓(xùn)計(jì)劃是按照一定的邏輯順序排列的紀(jì)錄纵诞，它從組織的戰(zhàn)略出發(fā)上祈。在全面、客觀的培訓(xùn)需求分析基礎(chǔ)上做出的對培訓(xùn)時(shí)間（when）浙芙，培訓(xùn)地點(diǎn)（where）登刺，培...
-
代碼解釋：os.environ['TF_CPP_MIN_LOG_LEVEL'] = '2'
（1）log信息共有四個(gè)等級，按重要性遞增為：INFO（通知）<WARNING（警告）<ERROR（錯(cuò)誤）<FATAL（致命的）;（2）值的含義：不同值設(shè)置的是基礎(chǔ)log信息...
-
tf.data.Dataset.from_tensor_slices的用法語義解釋：from_tensor_slices嗡呼，從張量的切片讀取數(shù)據(jù)纸俭。 工作原理：將輸入的張量的第一個(gè)維度看做樣本的個(gè)數(shù)，沿其第一個(gè)維度將tensor切片南窗，得到的每個(gè)切片是一...
-
《一日學(xué)習(xí)法》——半年內(nèi)揍很，從班級倒數(shù)第一，上升到全年級第一的學(xué)習(xí)方法（二）
本書的第二章5個(gè)秘訣主要是與如何備考相關(guān)万伤，如果有需要可以去看原著窒悔。 在這一章中作者提到了兩點(diǎn)，是對上一章關(guān)于記憶和睡眠的補(bǔ)充敌买。 1.“深入的看4小時(shí)不如一小時(shí)看一遍简珠，看4遍”...
