請問.rstudio這個文件夾在哪里呢掸刊?
如何解決RStudio Server: R is taking longer to start than usualRstudio server 在運行的時候自己斷掉了,重新登錄提示:RStudio Server: R is taking longer to start than usua...
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immunedeconv包號稱可以利用多種算法進行免疫細胞比例計算屏镊,包括quantiseq贸毕、timer试躏、cibersort斩披、cibersort_abs端姚、mcp_counter...
immunedeconv這個R包是一個免疫細胞比例估算集大成者,把常見的免疫細胞估算的算法都包括進去了挤悉,包括quantiseq渐裸、timer巫湘、cibersort、ciberso...
TCGA風(fēng)險模型類生信文章中昏鹃,經(jīng)常會對高低風(fēng)險組進行16種免疫細胞和13種免疫功能評分的比較尚氛,就會用到一個29個免疫特征的基因集(16種免疫細胞和13種免疫功能評分),如下圖...
0.緣起 很多文章中用到GEPIA這個網(wǎng)頁工具來進行TCGA和GTEx表達量的聯(lián)合比較洞渤,但在此之前我不知道要怎樣在R語言中實現(xiàn)阅嘶。?這個GEPIA的文章里說: The imba...
veen_eles = list(`Filt_low_umi\n(300)` = umi_low,
`Filt_high_umi\n(8000)` = umi_high,
`Filt_high_mito\n(14%)` = mito,
`Filt_high_ribo\n(3%)` = ribo)
library("ggVennDiagram")
這里提示沒有umi_low
復(fù)現(xiàn)2:AD與Normal細胞類型水平的差異基因挖掘(snRNA-seq)Single-nucleus transcriptome analysis reveals dysregulation of angiogenic endothelial c...
前面小編跟大家分享過一些科研熱點相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
前面小編跟大家分享過一些科研熱點相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
做實驗的朋友們對這個問題應(yīng)該是很感興趣的,因為涉及到后續(xù)能不能實驗驗證录语。 一般的做法是拿基因名或者蛋白名去查文獻癞尚,查網(wǎng)站。我知道的:uniprot惋耙、PDB捣炬、the human...
之前把服務(wù)器放在家里,通過花生殼軟件進行內(nèi)網(wǎng)穿透冲粤,采用http協(xié)議進行映射美莫。后來由于一些原因,http協(xié)議不能使用了梯捕,只能使用https厢呵。這個時候花生殼軟件映射Rstudio...
ssh進行l(wèi)inux遠程登錄時嫉拐,用戶名哩都、服務(wù)器名字都是一片白,也不顯示時間婉徘,如下圖: 生信技能樹賣萌哥老師提供了兩句代碼: 直接在ssh(以xshell為例)登錄后界面中粘貼...
@16fdc427cd90
pdf(file="x.pdf",width=8,height=6)
plotly::ggplotly(rssPlot$plot)
dev.off()
試試
pySCENIC的轉(zhuǎn)錄因子分析及數(shù)據(jù)可視化(三)參考生信技能樹:pyscenic的轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果展示之5種可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]漠嵌、py...
STRING進行的PPI分析咐汞?
pySCENIC的轉(zhuǎn)錄因子分析及數(shù)據(jù)可視化(三)參考生信技能樹:pyscenic的轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果展示之5種可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
library(SCENIC)一下儒鹿,看你SCENIC包安裝成功沒有化撕。
pySCENIC的轉(zhuǎn)錄因子分析及數(shù)據(jù)可視化(三)參考生信技能樹:pyscenic的轉(zhuǎn)錄因子分析結(jié)果展示之5種可視化[https://mp.weixin.qq.com/s/SIfyGzx4fwXPtQsVvvwwMQ]、py...
TCGAbiolinks包常用來TCGA的下載和各種常用分析约炎,本人在使用TCGAbiolinks下載和整理TCGA臨床信息時碰到一些麻煩植阴,具體如下: TCGAbiolinks...