??tRNA作為蛋白質(zhì)翻譯中氨基酸的轉(zhuǎn)運(yùn)小能手，發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。而另一個(gè)有關(guān)tRNA的特殊之處在于其及其豐富的修飾數(shù)量與類型拴泌。一個(gè)成熟的tRNA僅約72nt，平均每個(gè)t...
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2021-08-22 tRNA m7G修飾促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)化 -
R統(tǒng)計(jì)學(xué)(06): 負(fù)二項(xiàng)分布前面我們介紹了多種離散型概率分布，大家可以點(diǎn)擊下方鏈接來回顧： R統(tǒng)計(jì)學(xué)(01): 伯努利分布举户、二項(xiàng)分布 R統(tǒng)計(jì)學(xué)(02): 幾何分布 R統(tǒng)計(jì)學(xué)(03): 超幾何分布 R統(tǒng)計(jì)...
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慢病毒包裝實(shí)驗(yàn)so easy！詳細(xì)步驟及滴度測定看過來遍烦！
眼看著基因編輯越來越火俭嘁，而慢病毒基因表達(dá)系統(tǒng)是目前廣泛使用的基因編輯操作工具之一，因此慢病毒的包裝也慢慢越來越火服猪，成為目前各大實(shí)驗(yàn)室比較普遍的實(shí)驗(yàn)之一供填，然而，有不少科研小伙伴...
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不想再用慢病毒了蔓姚，我還有什么別的選擇嗎捕虽？piggyBac transposon慢病毒可快速、高效的將目的基因整合到宿主細(xì)胞基因組坡脐，非常適合用于構(gòu)建穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株泄私。但慢病毒也有缺點(diǎn)，即使是穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株备闲，可能會隨著傳代次數(shù)的增加而慢慢丟失干擾或者過表達(dá)的效率晌端。其...
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第04周-用LC-MS來找HCC的代謝標(biāo)記物
用LC-MS來找HCC的代謝標(biāo)記物 最近組會有個(gè)postdoc分享了這篇文獻(xiàn)，數(shù)據(jù)分析角度很簡單恬砂，但是實(shí)驗(yàn)階段很繁瑣咧纠，招募了大量的患者，文章是泻骤；A Large-Scale, ...
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代謝組基礎(chǔ)概念
代謝組學(xué)( Metabolomics 或Metabonomics )是有機(jī)化學(xué)漆羔、分析化學(xué)梧奢、化學(xué)計(jì)量學(xué)、信息學(xué)和基因組學(xué)演痒、表達(dá)組學(xué)等多學(xué)科相結(jié)合的交叉學(xué)科亲轨，旨在研究生物體或組織...
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用ggplot2畫代謝集富集分析（MSEA）圖MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis鸟顺，代謝集富集分析惦蚊，是代謝組數(shù)據(jù)分析方法的一種。MSEA是基因集富集分析...
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使用MetaboDiff包分析非靶向代謝組數(shù)據(jù)最近手里有個(gè)非靶向代謝組的數(shù)據(jù)讯嫂，通過學(xué)習(xí)MetaboDiff包來熟悉代謝組分析的思路和流程蹦锋，接下來的流程來自于MetaboDiff包官方幫助文檔。 1. MetaboDiff...
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人類心臟的蛋白翻譯組學(xué)藍(lán)圖在人類組織中的翻譯圖譜顯示欧芽，長鏈非編碼RNA和環(huán)狀RNA上預(yù)測的致病性變異的下游經(jīng)常被翻譯莉掂，本研究描述了數(shù)百個(gè)微蛋白的翻譯情況。 Highlights Ribosome pr...
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單端測序與雙末端測序
單端測序與雙末端測序 高通量測序的方式主要有： 單端測序 paired-end mate-paired(PE/MP)測序 當(dāng)要進(jìn)行多 個(gè)樣品同時(shí)測序時(shí)可以給不同的樣品添加不同...
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生信分析學(xué)習(xí)筆記 - RNAseq （二） 雙端測序與單端測序聲明：本文部分內(nèi)容和部分圖片來源于網(wǎng)絡(luò)千扔。本文為生信小白學(xué)習(xí)筆記巫湘，不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權(quán)威。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預(yù)處理昏鹃，序列回帖到數(shù)據(jù)可視化...
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前言科學(xué)-3D2Y<br><br>簡書博客<br><a href="http://www.reibang.com/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.reibang.com/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
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【測序?qū)嶒?yàn)】翻譯組測序的簡介和實(shí)驗(yàn)流程# 一洞渤、翻譯調(diào)控：原核生物：基因表達(dá)的調(diào)控主要在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行阅嘶；真核生物：由于RNA較為穩(wěn)定，除了存在轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控以外载迄，在翻譯水平上也進(jìn)行各種形式的調(diào)控讯柔。 # 二、控制真核...
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Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識（二）：19年植物綜述之Polysome Profiling护昧、RNC-Seq魂迄、Ribo-Seq、Ribo-Seq的比較Translatomics: The Global View of Translation 摘要： 在生命的各個(gè)領(lǐng)域中惋耙，蛋白質(zhì)都是由核糖體在翻譯過程中合成的捣炬。翻譯調(diào)節(jié)的幅度超...
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【NGS原理圖大全】-DNA-RNA-RNC-tRNA-smRNA
NGS原理圖大全-計(jì)劃涵蓋大部分Genome-Transcriptome-Translatome-tRNA-smRNA有關(guān)的技術(shù)。目前加粗字體的是有內(nèi)容的绽榛，其他只是空鏈接湿酸，徒...
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在loom文件中使用seurat處理單細(xì)胞數(shù)據(jù)
loom文件簡介：http://linnarssonlab.org/loompy/format/index.html[http://linnarssonlab.org/loo...
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進(jìn)化樹+蛋白結(jié)構(gòu)域目標(biāo) 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 依然查看help界面的Protein domains 在上傳數(shù)據(jù)的時(shí)候我們發(fā)現(xiàn)多了按鈕，可以從PFAM上上傳數(shù)據(jù)灭美，evolview使用的標(biāo)簽名必須與PFAM的...
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R語言畫棒棒糖圖（lollipop）展示snp在基因上的位置今天在一個(gè)微信群里看見有人問下面兩幅圖用R語言如何實(shí)現(xiàn) 第一幅就是散點(diǎn)圖 兩列數(shù)據(jù)x,y用來控制散點(diǎn)的位置推溃，一列變量用來映射顏色，F(xiàn)requency用來映射大小届腐。這個(gè)實(shí)現(xiàn)起來...
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bioinfo100-第10題-FastQC報(bào)告之a(chǎn)dapter與kmer參考： 孟浩巍的知乎zhn 第10題 讀懂FastQC報(bào)告之a(chǎn)dapter與kmer Hello大家好铁坎！ 我們又見面了蜂奸！今天是我們的FastQC中最后1次提問啦！今天硬萍，我們要...
