例子1:大青楊PuHSFA4a轉錄因子調控高鋅脅迫應答的機理研究
雙熒光素酶應用實例(一)1、驗證microRNA同mRNA靶向互作含滴。將待測基因的3’UTR序列插入報告基因載體氢拥,再共轉入該microRNA,檢測熒光素酶活性下降暂刘,則提示為其靶序列饺谬。 2、驗證mic...
串聯(lián)法和并聯(lián)法構建進化樹 串聯(lián)法(Concatenation):先將不同物種之間的每個單拷貝基因單獨進行多序列比對谣拣,然后將這些比對后的單拷貝基因進行首尾相連串接成一個supe...
參考這篇ID轉換不用怕欧聘,clusterProfiler幫你忙這篇詳細講了無參考基因組該怎么辦,值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID:Ensemble id:一般以ENSG開頭...
寫在前面 原本拇厢,我并無寫這一稿件的想法。主要原因有二: 網(wǎng)絡上已有相關資料較多晒喷,盡管類似的問題天天仍然有人問 再談起 GO富集分析孝偎,距離上次已是五六年,簡單來說凉敲,不想談 如果...
想來想去,倒是可以記錄一下最近的一些事件和思考爷抓。 刪了一行代碼势决,功能加速 100 倍 寫代碼也有好幾年了,盡管是業(yè)余工作蓝撇,但多少還是有一些提升果复。肉眼可見的是,開發(fā)速度明顯下降...
寫在前面 很多時候虽抄,我們會看到一些文稿,上來就是“我研究的物種如何如何重要”独柑。其中迈窟,最有說服力的,或許就是忌栅,基于“FAO STAT”车酣,品類產量幾何幾何。以前索绪,我也不多關注這個...
2005年,羅氏推出了第一款二代測序儀羅氏454拴袭,生命科學開始進入高通量測序時代读第。后續(xù)隨著Illumina系列測序平臺的推出,極大降低了二代測序的價格拥刻,推動了高通量測...
寫在前面 最近可能是不少人要趕畢業(yè)論文怜瞒,于是找上了 TBtools,并急急忙忙希望解決自己的問題。于是吴汪,他們總是會在群里 @我 或者 @管理員惠窄。事實上,這是一個違背群約定的事...
雖然我們一直在說可以“用別人的數(shù)據(jù),寫自己的文章”霜运,但是具體怎么操作脾歇,很多同學還是不清楚。今天就用一個完全用公共數(shù)據(jù)庫資源進行分析發(fā)文的例子來和大家分享下這方面的思路淘捡。 讀前...
隨著測序成本的不斷下降藕各,轉錄組測序分析已然成為生物學及醫(yī)學研究不可或缺的技術手段。 重點介紹一下轉錄組測序分析的相關知識焦除。 Question and Answer 1激况、什么是...
miRNA-seq分析流程 轉載2016-11-28 16:29:44 miRNA是生物中非常重要的一類非編碼小RNA,其在生物體的調控中具有非常重要的作用踢京,在人中大約三分之...