單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者月弛，Evil Genius 今天的目標(biāo)，實(shí)現(xiàn)如下的分析 對(duì)于空間轉(zhuǎn)錄組而言科盛，高精度平臺(tái)圖像分割獲取單細(xì)胞精度的矩陣絕對(duì)是必做的帽衙。大家如果選擇做高精度空轉(zhuǎn)，尤其Stereo-...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者贞绵，Evil Genius 針對(duì)visium厉萝、bin模式的Stereo-seq、HD等的腳本更新。 對(duì)于單細(xì)胞而言谴垫，大家網(wǎng)上找點(diǎn)代碼分析出個(gè)結(jié)果章母，已經(jīng)很容易了，但是想分析的...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者，Evil Genius 關(guān)于RCTD前弯，本來(lái)都不打算更新了蚪缀，R版本的聯(lián)合分析我覺得大家自己寫寫就完了，現(xiàn)在看來(lái)恕出，還是需要整理一下询枚。 文章在Robust decomposi...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者哩盲，Evil Genius 今天我們分享一個(gè)簡(jiǎn)答的內(nèi)容，空間細(xì)胞聚類與配受體共現(xiàn)狈醉。 今年的空間課程給了大家一個(gè)方法，當(dāng)然了惠险，都可以用苗傅，也都有高分文章引用，我們今天更新一個(gè)...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者班巩，Evil Genius 周末了渣慕，我們復(fù)習(xí)一下，高分文章的方法補(bǔ)充抱慌，文章在 (1)WES數(shù)據(jù)分析,如下 1逊桦、BWA-mem比對(duì)（GRCh38）2、使用samtools將輸...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者抑进，Evil Genius 今年不知道大家過(guò)的怎么樣强经？掙到錢了么？文章發(fā)表了沒(méi)寺渗？光陰似箭匿情，大家珍惜讀書的大好時(shí)光。 我們今天的分析從空間轉(zhuǎn)錄組生態(tài)位的轉(zhuǎn)變影響細(xì)胞狀態(tài)開始信殊，...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者炬称，Evil Genius 不止一次的說(shuō)過(guò)，做HD涡拘、Stereo-seq玲躯，盡量不要再用bin分割模式，采用圖像識(shí)別的圖像分割模式，獲取單細(xì)胞級(jí)別的空間矩陣跷车。 Stereo-...

單細(xì)胞空間交響樂(lè)

作者，Evil Genius 我們今天要實(shí)現(xiàn)的目標(biāo)是不铆，依據(jù)細(xì)胞鄰域的不同進(jìn)行細(xì)胞類型的分層聚類蝌焚。 我們?cè)诜治龈呔绕脚_(tái)的時(shí)候，通過(guò)基礎(chǔ)分析誓斥，會(huì)拿到聚類結(jié)果只洒，經(jīng)過(guò)注釋之后，會(huì)獲...