這一篇，我們繼續(xù)總結(jié)类腮，這里用到的PPT是我給產(chǎn)品技術(shù)培訓(xùn)用的PPT臊泰，當(dāng)然了，有一些內(nèi)容一筆帶過蚜枢，有的地方詳細(xì)講了講缸逃，免費(fèi)分享給大家，祝愿大家科研順利厂抽，喜歡生物信息的需频，喜歡單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組的，都能在這個(gè)領(lǐng)域有所成就
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軌跡推斷方式
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軌跡推斷的軟件總結(jié)
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最流行的方法筷凤，RNA速率
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最好的軌跡推斷組合
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通訊軟件合集
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通訊軟件的最新進(jìn)展
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單細(xì)胞最好的腫瘤識(shí)別方法
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一定要指定ref
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樹形圖體現(xiàn)異質(zhì)性更加直觀
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結(jié)合起來更加給力
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權(quán)重表達(dá)
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關(guān)聯(lián)表型
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下游分析
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模塊聯(lián)系
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最好的尋找元程序的方法---NMF
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解釋性更強(qiáng)
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元程序表征性更好
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單細(xì)胞 + VDJ昭殉，motif很重要
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TCR本身就可以尋找相似性
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核心半徑難定義
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位點(diǎn)結(jié)合多態(tài)性
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兩者h(yuǎn)it更準(zhǔn)確
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強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)合
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差異基因 & motif
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CoNGA更直觀
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BCR分析更深入
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基因豐度表差異
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都是尋找motif
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單細(xì)胞 && 空間
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空間基因開關(guān)
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腫瘤邊界微環(huán)境
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聯(lián)合表征空間細(xì)胞分布
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腫瘤離得近，才能聽得清
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空間通訊分析不能搞一刀切
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距離表征組織有序性
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你不來找我，我就來找你
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空間模塊很重要
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空間表征顯異質(zhì)
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沒有什么是模塊不能劃分的
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空間CNV圖譜
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腫瘤確有異質(zhì)性
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生活很好饲化，有你更好莽鸭，我們江湖再見
